城市轨道交通运营调度应急指挥组织系统包括介绍如下：
(1)行车组织指挥体系
行车组织指挥体系是城市轨道交通系统的核心，通过控制中心行车调度员的实施，实行高度集中，统一指挥，使各个环节协调运作，保证列车安全、正点运行。
(2)供电指挥体系
在城市轨道交通供电指挥中，控制中心电力调度是主要的调度指挥，它接受本身控制中心主任的直接指挥的同时，还接受地方电力调度的指挥。当地方电力系统有相关信息时，由地方电力调度通知到运营控制中心的电力调度。
(3)应急指挥体系
在轨道交通应急指挥体系中，控制中心的主要职能是信息收发中心，收集和将信息传达到相关单位及个人。在应急现场一般会成立现场总指挥，负责现场的抢险救援的指挥工作，同时考虑各方面的需要，相应成立行车客运组织及抢险救援、现场疏导、应急监测、医疗救治、新闻信息等组别，而这些组别通常由轨道交通各专业抢修队、相关职能部门组成。 2．列车运作有哪几个环节?
列车运作根据列车每日运用过程，可以分为四个环节：列车出厂、列车正线运营、列车收车、列车场内整备和检修。
(1)列车场内整备
列车整备在运用库进行，在每次列车运行前由司机根据有关规定进行列车功能性检查，司机对司机室照明、仪表指示灯、雨刷、喇叭、停车制动、常用制动、快速制动、紧急制动及车门系统等进行操作检查。
(2)列车出厂
司机对列车的整备作业完毕，确认是否符合正线服务条件，如符合，则到达规定的出车时间后，报告车厂信号楼值班员整备作业完毕，确认出厂信号开放，驾驶列车出库，到达转换轨处一度停车，待收到速度码，确认进路信号开放后，进入正线。
(3)列车正线运营
正常情况下，进入正线后的列车按时刻表要求进行运作，执行运输乘客的任务。司机注意观察列车显示屏信息!各种指示灯和仪表显示，自动开关状态。运行中不断了望进路，发现危及行车安全的情况立即采取紧急措施。
(4)列车收车
列车由正线进入车辆段，行调联系信号楼值班员排列进场进路，司机确认进厂信号机开放后，进入车辆段。列车在停车库停稳后，司机携带列车钥匙、司机报单及其他相关物品与运转值班队长办理退勤手续。
(5)列车场内检修
列车回库停稳并按规定收车后，运转值班员与车辆维修部门办理车辆交接手续，由车辆维修部门进行维修作业。维修作业完毕，检修负责人与运转值班员办理车辆交接手续，运转值班员确认车辆技术状态符合运营要求后方能接受投入正线使用。