通州境域，初为长江口海域中几块相邻的沙洲，南北朝中期出水，唐末与大陆涨接。五代初称静海镇。后周显德五年（958年）建通州，领静海、海门两县，属扬州。静海县辖有狼山、蔡港、西寨、石港、余庆五寨地。宋仁宗天圣元年（1023年）改通州为崇州，又名崇川，属淮南东路；明道二年（1033年）仍称通州；徽宗政和七年（1117年）改为静海郡，不久复名通州，属扬州。元世祖至元十五年（1278年）升为通州路；至元二十一年复为通州，属扬州路，隶江北淮东道廉访司。明洪武元年（1368年）废静海县，通州直管静海本土，领海门、崇明两县，属扬州府；洪武九年划崇明县归苏州府，通州仅领海门一县。嘉靖年间（1522～1566年），通州除州城外，分6乡6场。清顺治二年（1645年）属江南省扬州府；康熙六年（1667年）起属江苏省扬州府；康熙十一年，因江岸坍没，海门省县为乡，并入通州；雍正二年（1724年），升为直隶州；宣统元年（1909年），设定3市区、10镇区、8乡区；宣统二年，市区、镇区改为市，乡区改为乡。
中华民国元年（1912年）5月，废州，改称南通县，属江苏省；全县仍设13市、8乡，民国9年增设三余乡。民国18年，市乡合并为18个区，区下设镇、乡、闾、邻；民国23年又并为13个区，区下设镇、乡、保、甲。抗日战争与解放战争时期，多种政权并存，行政区划变化频繁。
1949年2月2日，南通县全境解放后，划城区及港闸等地另置南通市；南通县政府移驻金沙镇，属南通专署管辖。同年10月，全县行政区划为12个区、159个乡。1956年2月和1957年10月两次并区并乡后，全县为8个区47个乡，3个县属镇，2个区属镇。1958年3月，撤销区建制，设通海、通中、通东、通北、通西5个片。1958年成立38个人民公社，实行政社合一，公社下设大队，大队下设生产队；后公社范围逐步调小，至1982年全县有61个公社、5个县属镇。1961年9月，恢复8个区建制；1966年增设十总区。
1983年实行市管县体制，属南通市管辖。同年，政社分设，公社改为乡，大队改为村，生产队改为村民小组，年末，全县为9个区、60个乡、5个县属镇、1个海洋渔业公社。1984年5月，实行镇管村体制，全县设14个镇、43个乡，以后各乡先后改建为镇。1987年2月，撤销区委、区公所，按原行政区域设9个区工委和指导组。1991年1月，陈桥、幸福、秦灶、新开3乡1镇和小海镇的6个村划归南通市区后，县境面积为1637平方公里，人口145万有余。1992年末，全县为17个镇、32个乡、1个海洋渔港管理委员会、36个居民委员会、884个村。
1993年2月，南通县撤销改设通州市。1996年4月机构改革中，9个区工委、指导组撤销。2000年全市行政区划再次调整，原49个乡镇撤并为26个。2001年4月，观音山、小海、竹行3镇和市良种场、种畜场划归南通市区，通州市行政区域内的南通农场（省属）和东方红农场（省属）也划入南通市区范围。2002年末，通州市辖23个建制镇，3个街道办事处，376个村，52个社区，5个农场，总面积1351平方公里，总人口128.13万人。
通州和北京的其它郊区线不一样，可能一些后到通州的不太熟悉通州的历史。
通州的历史并不比北京短，今年是通州建制2300周年。
古老的京杭大运河最初建于隋朝，其起点就在通州，而不是在北京。（如果有谁新搬入通州还没有见过京桥运河，那一定要抽时间去看看啊。运河就在通州城东面）
明清时期，由于从南方来的货物都沿运河运到通州，再从通州改由陆路运到北京，使得通州成了进京的必经之地，以运河码头为中心的地带颇为繁华。
后来，由于运河淤积严重，无法通船了；再加之京津铁路修通后，由天津海港运至北京的货物改由铁路运输了，而京津铁路并不经过通州，而是经过廊坊，使得通州的重要性下降了。
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