没有强有力的管理，就没有好的质量、效果和效益，也就没有物探工作的健康发展。物探专业和地质专业之间，在管理内容和方式上，既有共性，也有特性。多年来，除了加强具有共性的管理外，也针对物探特性，采取了一些管理措施，并通过改革不断有所改进。
1.建立专业管理体制
由于技术基础和工作方式上的独特性，在地质工作中物探被认为是“特种兵”，需要有相应的管理体制。实践表明，在计划经济体制下，建立适当的专业管理系统，把集中管理和分散管理结合起来，以集中管理为主，进行有效运作，是物探事业得以顺利发展的组织和体制保证。地质部门是如此，其他工业部门也是如此，只有具体方式上的某些差异。
随着社会主义市场经济体制的深入发展，公益性和商业性物探工作的区分逐渐强化，物探工作主体多元化，市场调节作用增强。专业管理机构建设和运作方式有了新的变化。项目管理的作用愈益明显。监理制度在发展。一些不属于矿业公司或地质勘查企业的独立物探技术服务公司，通过同顾主签订合同承担任务，甲乙双方分别执行管理功能。
2.加强技术管理
物探的专业特殊性，更多地体现在技术工作中，加强技术管理十分必要。其主要任务和目的是，通过建立健全规章（规范）制度，搞好计划、组织、指挥、控制、协调，处理好内部各个环节的工作及其间的关系。这些环节一般包括：任务安排、技术设计、数据采集、资料处理反演、成果综合解释、报告编写和异常查证等。它们并非截然划分彼此孤立的，而是有机衔接密切联系的。要发挥管理功能，处理好各环节之间的关系，解决好这些环节的核心问题。概言之，就是要抓好任务设计的合理性、采集的可靠性、处理反演的正确性、解释的科学性、报告的完整性和查证的及时性。为此，各单位都建立了适当的组织形式，健全各种规章（规范）制度，加强组织、协调和监督检查，保证物探工作在一定的具体条件下，能够按照自身的基本规律进行。这是物探能否取得成效的关键所在。进入社会主义市场经济时期，一些单位正在按照国际惯例和标准，建立保证质量管理系统。
3.搞好外部协作，处理好物探同其他专业、工种的关系
地质工作具有综合性。实践证明，运用系统思想，实现地质、物探、化探、探矿工程及其他专业、工种的最佳结合，是取得最好地质成果和经济效益的正确途径。这种结合是双向性的，是建立在有关专业工作人员具有较高的综合知识素质，以及工作目标的共同认识、有关情况的经常沟通、成果信息的及时交流、存在问题的深入讨论、不同观点的充分交换和分歧意见的正确处理基础上的。科学管理的目标是，既要保持各种方法手段的专业性，充分发挥其特长，又要保持彼此间的密切配合，发挥综合效应，以便更经济有效地取得各项成果。
物探和其他各种专业、工种之间的关系，有不同特点，都必须处理好。其中以物探和地质的关系更具有复杂性、重要性和全程性。物探和地质的密切结合，应贯穿于任务的确定、设计的编制、数据的采集和处理、地质地球物理模型的建立以及一系列定性和定量解释，直到取得最终成果的全过程。高水平的物探和地质结合，是取得高水平物探成果的重要条件。任何脱离地质的偏向，都将造成工作的损失。从另一角度来说，地质方面任何不重视物探的现象，也必将造成工作中的损失。我国在多年实践中，摸索了若干促进物探、地质结合的经验。其中最基础的是，专业人员应具有较高的综合知识素质，对地球科学和地质工作的综合性有正确认识。这种人才的培养，需要从学校教育做起。
搞好管理，从广义来说还涉及经营问题。搞好经营，在竞争中取胜，在市场经济体制下，对提高物探工作的经济效益、充分实现物探的有效性，更具有其重要意义。这种竞争首先是科学技术能力的竞争，同时也是管理能力和决策能力的竞争。从一些事例来看，有效宣传自己的技术和成果，建立良好的社会信誉，主动寻求客户，具有相对稳定的市场关系和较宽阔的经营渠道，及时取得资金支持，能够吸收和留住所需优秀人才，掌握有竞争力的专业特长和技术优势（通过引进或自主创新），是物探勘查单位，特别是独立物探企业能够圆满完成合同任务，取得经营胜利的重要因素。