公安系统能查微信聊天记录。但是正常情况下是不会查询微信用户的微信聊天记录信息的。在因有办案需要时，经过领导审批同意后，会查询用户的微信信息记录，但也要履行保护隐私的义务。
法律依据：
1.根据
《宪法》第四十条规定，
中华人民共和国公民的通信自由和通信秘密受法律的保护。除因国家安全或者追查刑事犯罪的需要，由
公安机关或者检察机关依照法律规定的程序对通信进行检查外，任何组织或者个人不得以任何理由侵犯公民的通信自由和通信秘密。
2.根据
《刑事诉讼法》第一百四十三条规定，侦查人员认为需要扣押犯罪嫌疑人的邮件、电报的时候，经公安机关或者人民检察院批准，即可通知邮电机关将有关的邮件、电报检交扣押。 不需要继续扣押的时候，应即通知邮电机关。