第11话《钢琴奏鸣曲《月光》杀人事件》一小时特别篇
第52话《雾天狗传说杀人事件》一小时特别篇
第76话《柯南对怪盗基德》一小时特别篇
第118话《浪花连续杀人事件》一小时特别篇
第129话《来自黑暗组织的女子！大学教授杀人事件》二小时特别篇
第162话《飞天密室！工藤新一首次的事件》一小时特别篇
第219话《名侦探的聚会！新一vs怪盗基德
》二小时特别篇
第263话《大阪双谜！浪花剑士与太阁之城》二小时特别篇
第304话《震憾警政厅！1200万人质》二小时特别篇
345话《与黑色组织面对面
满月之夜的双重迷案》两个半小时特别
第356话《怪盗基德令人惊异的空中漫步》一小时特别篇
第425话《黑色冲击!
组织之手伸来的瞬间》二小时特别篇(柯南唱歌，卡哇伊)
第449话《总局刑警恋爱物语！虚假的结婚典礼》一小时特别篇
第452话《金比罗剧院魅影》一小时特别篇
第479话《和服部平次在一起的三天》二小时特别篇
第488话《电视台的恶魔》一小时特别篇
第490话《服部平次vs工藤新一
滑雪场的推理对决》一小时特别篇
《怪盗基德的瞬间移动魔术》一小时特别篇
第516话《风林火山
迷宫的铠甲武士》一小时特别篇
第522话《新一的真实身份
兰的眼泪》一小时特别篇（包括521和523）
《
鲁邦三世VS名侦探柯南》二小时特别篇
OVA
16名嫌疑犯
（大团圆，后面大家一起唱歌好搞笑）
女子高中生侦探
铃木园子事件簿（小孩子们的丰富想象力）
迷之墙和黑色拉布犬事件
目标是
小五郎！！少年侦探团的秘密
调查。
柯南
VS
Kid
VS
Yaiba
宝刀争夺大作战！
追踪消失的钻石！柯南·平次VS
KID
十年后的陌生人