考核侧重点不同：“会计实务信息化证”侧重考核考生会计实务工作能力及信息化运用水平，与学习者将来就业高度匹配，是一本含金量高能力证书。证书内页考核科目与实际工作内容相吻合，学的、考的就是将来学生用的。“会计从业资格证”侧重考核考生会计基础知识，重理论轻实践，学习内容较泛，学完后达不到立即上岗的目标。考生取证后面对会计实务工作和信息化系统仍然还是无所适从，无法立刻上岗，这也是“会计从业资格证”即将被取消的一个重要原因。
学习方式不同：“会计实务信息化证”采用 O2O 学习方式，既有课前基础知识的预习，又有课中的实际业务处理（含网银、电算化、开票、报税等），课后还有相应的实践和理论考核环节，支持移动学习与 PC 学习。“会计从业资格证”采用理论讲授方式，侧重于知识的讲解，课后以理论考核为主，电算化部分操作较为简单，无法达到实际工作中的真正要求。
考核方式不同：“会计实务信息化证”采用实践考试，考试侧重考核实际应用和解决问题的能力，出纳、账税一体化均进行操作层面的考核，体现“实务”与“信息化”两个方面的考核，与就业高度结合。“会计从业资格证”采用无纸化考试，考试题型以单选、多选、判断为主，电算化考核仅限于总账基本操作层面的考核，侧重考核基础理论知识，与就业脱离较远。
会计信息化证（又称:全国会计实务信息化应用能力证书）是由中国商业会计学会牵头，根据《国家中长期人才发展规划纲要（2010-2020年）》和《专业技术人才知识更新工程实施方案（2010-2020年）》，依托“工业和信息化领域急需紧缺人才培养工程”，结合中国商业会计学会组织人才认证体系，在全国范围内开展“APOIT标准全国会计实务信息化应用能力”人才培养工作。其中培训合格并通过“全国会计实务信息化应用能力”考试者可获得由中国商业会计学会、中国国际贸易促进委员会颁发的《全国会计实务信息化应用能力证书》（又名：会计信息化证）。
参加APOIT标准全国会计实务信息化应用能力考试并考试合格的学员，可获得该证书，表明持有者已经通过相应的实训考核，具备了一定的技术水平和就业能力。会计信息化证是会计从业人员实务技能的标准，会计信息化证与会计从业资格证是会计人员认定实务技能和理论知识必备的两本证书。
