截至2019年6月24日，杭州地铁5号线起于良睦路站，途径余杭区、西湖区和拱墅区，止于善贤站，共设12座车站 。
1、良睦路站
位于余杭塘路与良睦路交叉口，沿余杭塘路东西向布置。是地下二层岛式站。
2、杭师大仓前站
位于余杭塘路与高教路交叉口，沿余杭塘路东西向布置，临近杭师大仓前校区。站点周边为杭师大仓前校区、阿里巴巴西溪园区，浙能海创园等。
3、永福站
位于海曙路与常二路交叉路口，沿海曙路东西向布置，西北象限为杭师大校园地块，东北象限为富力在建商住地块，西南象限为万科星空商住体，东南象限为规划教育用地。
4、五常北站
位于海曙路与创意路“T”型交叉口以东，沿海曙路东西布置。车站北侧为五常车辆段和商住混合用地，南侧为公园。
5、蒋村站
位于花蒋路和余杭塘路交叉口西侧，横跨蒋村四号路。
6、浙大紫金港站
位于余杭塘路和崇仁路交叉口，在浙大紫金港校区西区附近。
7、三坝站
位于杭州市西湖区三墩镇三坝村萍水路与古墩路交叉口处，为2号线和5号线的换乘站。
8、萍水街站
位于萍水街和塘萍路的交叉口，设4个出入口。
9、和睦站
位于位于萍水街与莫干山路交叉口，和睦社区辖区内，沿萍水街东西向布置。是5号线与10号线（在建）换乘站。
10、大运河站
位于桥弄街与通益路交叉口，沿桥弄街东西向布置，东临大运河。
11、拱宸桥东站
位于衢州街与上塘路交叉口，沿衢州街东西向布置，西临拱宸桥。站点周边有杭州市树人小学、杭州拱墅区职业高级中学、登云路农贸市场、运河文化广场等。
12、善贤站
位于沈半路舟山东路交叉口以南，是杭州地铁3号线和5号线的换乘车站，3号线将于2021年年底开通。此车站东北侧为善贤人家住宅区，西北侧为树人大学、省妇保宿舍等。
参考资料来源：百度百科—杭州地铁5号线
车站名称具体位置换乘线路科技岛站水乡北路和绿汀路交叉口 临安线垂直换乘，3号线同台换乘创新路站暂无信息---中央公园站姚家东路西侧，红卫北路北侧---仓前站海曙路和良睦路交叉口---杭师大站杭师大仓前校区门口---常二路站海曙路和常二路交叉口---五常站海曙路和邱桥路交叉口以东---蒋村站花蒋路和余杭塘路交叉口以西---浙大紫金港站余杭塘路和崇仁路交叉口---三坝村站萍水路和古墩路交叉口2号线（在建）益乐路站益乐路和萍水路交叉口---莫干山路站萍水东路和莫干山路交叉口10号线（规划中）巨州路站通益路上---上塘路站上塘路和衢州路交叉口以东---沈半路站杭州灯具市场区块内3号线（规划中）再行路站重工路和西文路交叉口以西---东新园站东新路和香积寺路交叉口8号线（规划中）城市之星站东新路和胜景东路交叉口---打铁关站与1号线打铁关站垂直1号线（运营中）宝善桥站建国北路和莫衙营交叉口---建国北路站建国北路和凤起路交叉口2号线（在建）平海路站建国中路和平海路交叉口以北---城站站位于杭州火车站下方1号线（运营中）江城路站江城路和河坊街交叉口7号线（规划中）候潮路站江城路和候潮路交叉口---南星桥站钱江路和飞云江路交叉口4号线（在建）长河路站长河路和江南大道交叉口6号线（在建）江虹路西站滨康路和长河路交叉口---江晖路站江晖路和滨康路交叉口---滨康路站滨康路和风情大道交叉口1号线（运营中）青年路站金城路和青年路交叉口---金鸡路站金城路和金鸡路交叉口14号线（规划中） 人民广场站垂直于2号线人民广场站2号线（运营中）育才路站金城路和育才北路交叉口---通惠路站金城路和通惠路交叉口---火车南站站位于杭州火车南站东广场下方11号线（规划中）新城路站新城路上---香樟路站彩虹大道和S103省道交叉口以西绍兴线、13号线、14号线（规划中）
