答：恢复出厂设置是一种清理手机内存的设置，若是您恢复出厂设置之前没有备份手机短信，短信将会被删除。
短信如何恢复：
打开iTunes软件，然后将苹果6S手机与电脑进行连接。稍等几秒钟，待手机与电脑连接成功后，在iTunes软件界面上依次点击左上角的手机小图标，然后选择“本电脑”，点击“立即备份”按钮，然后在弹出窗口中点击“不备份应用程序”，即依次点击下图中的1，2，3，4处，这样做，是为了将手机里面所有数据导出到电脑上来。
备份的时间与您手机上安装的软件的多少有关，可能会需要几分钟到几十分钟不等，请耐心等待。当备份完成后，窗口顶部的进度条将消失。当您看不到顶部的进度条后，说明备份已经完成，下图为正在备份时的窗口界面。
打开“PP助手”软件，点击“工具箱”，“iTunes备份管理”
双击刚才备份下来的这一行数据。
在弹出窗口的左侧，我们可以看到“短信”，我们点击它，再点击选中的“sms.db”，再点击“导出”按钮，将该文件进行导出。
打开“楼月手机短信恢复软件”，然后点击菜单“文件”，“打开短信数据库文件”，然后选择刚才导出来的sms.db文件。
然后我们再点击菜单“文件”，“恢复已删除短信”，然后软件将开始扫描。
稍等片刻后，软件将弹出窗口，提示成功恢复的短信条数，此时您可以点击左侧的手机号码列表来查看苹果6S手机上所有已删除的手机短信。