Do you have a computer in your room？
翻译过来就是：你房间里有电脑吗？
肯定回答：Yes,I do。 否定回答：No,I don't。
解析：do you have中have是实义动词，有的意思，所以我们回答的时候千万不能用，yes ,I have.这样来回答，只能用使用助动词do来进行肯定或者否定的回答。您题目的中 three is 就更不对了。
举例：
Do you have a pen? Can you lend it to me？
你有钢笔么？能不能借我用用？
Do you have any apples? I'll trade you pears。
你有苹果吗？我用梨跟你换。
回答都是用 Yes,I do。 否定回答：No,I don't 来对对方进行回复。