区别：1、所属阶段不同
工会筹备金是用于筹建工会工作的，在未建立工会的的但具备设立工会组织条件的企业、事业单位、机关和其他经济组织阶段。工会经费则是公司成立了工会，规定比例提取工会经费。
2、从属规定制度不同
《中华人民共和国工会法》第四十二条规定：“建立工会组织的企业、事业单位、机关按每月全部职工工资总额的2%向工会拨缴的经费。”
《中国工会章程》第三十七条规定：“未成立工会的企业、事业单位、机关和其他社会组织，按工资总额的2%向上级工会拨缴工会建会筹备金”。
法律依据：《中华人民共和国工会法》第四十二条规定：建立工会组织的企业、事业单位、机关按每月全部职工工资总额的2%向工会拨缴的经费。
《中国工会章程》第三十七条规定：未成立工会的企业、事业单位、机关和其他社会组织，按工资总额的2%向上级工会拨缴工会建会筹备金。