1943年白公馆被改为中美合作所第三招待所后，所关押政治犯必须外迁。
军统总务处长沈醉亲自开着一辆吉普车到处察看，最终选中了渣滓洞作为关押原白公馆看守所内犯人的新址。
1946年7月，息烽监狱、望龙门看守所撤销，息烽、望龙门、渣滓洞监狱兼看守所合为渣滓洞监狱兼看守所，并将原息烽、望龙门监狱兼看守所的全体在押人员撤并渣滓洞监狱兼看守所。
中美合作所撤销后，犯人于1947年4月回迁，渣滓洞监狱被合并至白公馆看守所，但暂时废弃。
1947年12月，渣滓洞重新关押犯人，称“重庆行辕二处第二看守所”。
关押的人员主要是1947年“六一大逮捕”中抓捕的教育、新闻界人士，“小民革”地下武装案被捕人员，上下川东三次武装起义被俘、被捕人员，《挺进报》事件被捕人员，民革川东、川康分会成员等，最多时关押过三百多人。
江竹筠、许建业、余祖胜等曾在此关押过。
1949年11月底重庆解放前夕，囚禁于此的二百多位革命志士被杀害。
渣滓洞在重庆市歌乐山麓，距白公馆2.5公里。
渣滓洞原是重庆郊外的一个小煤窑，因渣多煤少而得名。
渣滓洞三面是山，一面是沟，位置较隐蔽。
1939年， *** 军统特务逼死矿主，霸占煤窑，在此设立了监狱。
分内外两院，外院为特务办公室、刑讯室等，内院一楼一底16间房间为男牢，另有两间平房为女牢。
关押在此的有“六一”大逮捕案、“小民革”案、“挺进报”案、上下川东三次武装起义失败后被捕的革命者，如江竹筠、许建业、何雪松等，最多时达三百余人，此地还曾居住过“小萝卜头”和他们一家人。
1949年11月27日 *** 特务在溃逃前夕策划了震惊中外的大屠杀，仅15人脱险。
有文艺作品《烈火中永生》《红岩》《江姐》等以此为原型。