《奇点》游戏四个结局是：中立结局，完美结局，屠杀结局，伪完美路线。
1、中立结局
只要不是完美或是屠杀结局，结局就是中立结局。中立结局有21个，取决于主角于怪物们的关系的一个结局。而中立结局无一例外的都是结尾sans和玩家打电话。
2、完美结局
又称和平路线。这个结局需要玩家在游戏中不杀掉任何一个敌人。此外，玩家需要同时与三名指标性角色Papyrus、Undyne以及Alphys变成朋友。玩家不能获取任何经验值，也就是说主角从头到尾都会停留在LV 1。
3、屠杀结局
屠杀路线需要玩家去杀死所有地区的所有敌人，包括废墟、雪镇森林、瀑布、热地/核心。这也包括要杀掉所有的头目，也就是头目怪物。
4、伪完美路线
在玩家完成过屠杀路线后，如果玩家交易了他们的灵魂，那么游戏又可以再重新开始。然而，如果接下来他们玩完美路线，就会出现的是被Chara修改过的结局。
流程和结局：
游戏开始时主角坠落在了Kartoga-12岛上，这时候的岛是处在正常时间线的，因为在1950的奇点爆炸（游戏背景有介绍），D博士（将军）死在火灾里，B博士没了D博士的帮助没能发明出TMD，再加上奇点的出现，因此苏联放弃对E99的开发，并把小岛封存了，因此这时候的小岛上是没有怪物和MIA12的士兵的，也没有奇点反应炉那冲天光柱。
而主角就在这时进入了K12研究院的废墟（这里有个细节要注意，斯大林头像背后的沙盘后面只是一堵墙）然后奇点爆炸，主角穿越时空来到了1950刚爆炸的研究院，并在火海中救了D博士（将军），让整个时间线在1950硬拐了个弯。
所以当主角再次回到2010时，整个小岛就发生了变化，D博士没死在火灾中，对E99元素的研究便没有中断（还记得沙盘后面的墙么，现在变成了门，说明在1950的火灾后，研究院没有被废弃，而是在继续扩建），而B博士在D博士的帮助下，在1955年发明了TMD。
这时候D博士看出了TMD的价值，想要独吞这项发明，而B博士拒不交出TMD，结果D博士发动了政变，占领了小岛并杀死了B博士，没有得到TMD的D博士转向了其它研究，独自开发了E99炸弹并把奇点改造成了反应炉，还试图利用E99改造人体创造出超级士兵，结果出现了各种怪物。
当主角从1950返回到被改变的2010，看到的是遍地的怪物，MIA12的士兵和之前没有的反应炉的光柱，主角的任务也从调查小岛变成了阻止反应炉的爆炸。在前往反应炉的路上，主角被MIA12的将军（D博士）俘虏，将军向他追要TMD，而主角根本不知道他在说什么，就在快被枪决的时候被女主角救下，并给主角出示了预言书，上面说主角将会拿到TMD并返回1955救下B博士并阻止将军。
于是主角在预言书的指引下拿到了TMD，并认命的跑回1955救下B博士，然后在B博士的指挥下穿梭于1955和2010之间收集物品，升级TMD，顺便打打小怪兽，调教下新旧士兵，一路跌跌撞撞的来到了反应炉处，然后把E99炸弹带到了反应炉没崩溃的时代引爆，试图阻止反应炉的崩溃。
可是当主角回到现代的时候却发现反应炉依然崩溃在即，一转身却发现了将军出现在B博士身旁，在一堆废话后，主角才知道原来一切的起因都是他在1950的火场上救下了将军，要结束这一切只有返回1950去杀掉救下将军的自己。
这时候故事就进入了尾声，根据你做出的选择游戏有3个结局和1个无限轮回：如果你杀死了B博士，那么你会帮助将军修复E99反应炉并用自己的TMD和将军征服世界，MIA12先解决了苏联，然后吞并了全世界，最后将军觉得主角功高盖主，于是在被征服的美国开发自己的TMD，世界进入了新的冷战格局。
如果你把将军和博士都杀了，那么没人能阻止反应炉的爆炸，这次爆炸摧毁了阿拉斯加和西伯利亚，MIA12的残余份子到处寻找杀害将军的凶手（主角），E99的扩散导致怪物急剧增加，最后摧毁了美国和苏联，主角却在杀了博士和将军后失踪，后来在被摧毁的美国出现了救世主，据说是拥有神之手的男人。
最后一种结局和无限轮回是一体存在的，主角杀死了将军，然后回到了了1950的火海，看到正背着D博士（将军）的自己，这时有2个选择，不开枪，那么现在的主角死在了火海，而过去的主角将重复你所经历的一切，进入了无限的轮回；开枪杀死自己，就会发现自己出现在没登上小岛前的直升机上，然后基地传来通讯，取消了小岛的探查任务，一切都结束了，时间回到了正常轨道。