1.装卸镜头
（1）装卸目镜：将选用的目镜插入镜筒上端，使十字丝处于东西、南北方向上。
（2）装卸物镜：因显微镜类型不同，物镜的装卸有下列几种情况：
1）弹簧卡型：将物镜上的小钉夹于弹簧卡子的凹陷处，即可卡住物镜。
2）转换器型：如上海XPG型偏光显微镜，先将物镜装于物镜转换器上，再将选用倍数的物镜筒下方转至弹簧卡住为止。否则物镜将偏离中轴，而不能观察。
3）螺丝扣型：将欲用的镜头拧紧在镜筒下边的镜头丝扣上即可。
4）楔型：镜筒物镜连接部位为一楔形，镜头的相应部分为一楔型槽。装卸时将镜头推进或拉出即可。
2.调节照明（对光）
装好中倍物镜及目镜，推出上偏光与勃氏镜，打开锁光圈，接通光源照明线路，或安上反光镜，转动反光镜至视域最明亮为止。注意勿使反光镜正对日光，容易使眼睛疲劳。
3.调节焦距（准焦）
调节焦距是为了能使薄片中的物像清晰可见，其调节步骤如下：
（1）将需要观察的矿物薄片，置于载物台中心，用薄片夹夹紧。必须使薄片的盖玻璃朝上，否则不能准焦。
（2）从侧面看着镜头，转动粗动螺旋，将镜头下降到最低位置，若用高倍物镜则需下降到几乎与薄片接触为止。
（3）从目镜中观察，同时转动粗动螺旋，使镜筒缓缓上升，直至视域内物像较清楚后，再转动微动调焦螺旋，直至物像完全清楚为止。
4.校正中心
在偏光显微镜的光学系统中，载物台的旋转轴、物镜中轴、镜筒中轴以及目镜中轴应当严格在一条直线上。此时旋转物台，视域中心的物像原地转动，其余的物像则绕中心作圆周运动。
在实际工作时，物镜中轴与物台旋转轴有时不在一条直线上（叫做“偏心”，或中心不正），因此，当旋转物台时，一个本来在十字丝交点的物像，会离开视域中心，甚至跑至视域之外，妨碍进一步观察，尤其是使用高倍物镜时，视域范围很小，如物像不在视域中心，根本无法观察。因此必须进行中心的校正，使物台旋转轴与物镜中轴吻合。
显微镜的镜筒中轴是固定的，大多数物台旋转轴也是固定的，在实际工作中，只能校正物镜中轴。也有少数显微镜的物台旋转轴可以校正。
校正中心之前，首先检查物镜安装是否到位。如果物镜没有安装在正确的位置上，不但不能校正中心，而且容易损坏校正螺丝。
校正中心的具体步骤如下：
（1）将物镜安装在正确的位置上，准焦后，在薄片中选一点a，移动薄片，使点a位于视域中心（十字丝交点处）（图3-5A）。
（2）将薄片固定，旋转载物台一周。若中心不正，则点a必离开中心o点，以另一圆心作圆周运动（图3-5B）。
（3）旋转载物台180°，使a点从十字丝交点位置转至最远，则a与o连线的中点o＇，为a点旋转轨迹中心，即偏心圆的圆心（图3-5C）。
图3-5 中心校正步骤示意
（4）转动校正中心螺丝，使a沿ao连线向o移动1/2ao的距离（即o＇移至o处），即初校完成（图3-5D）。
（5）旋转物台检查，若已校好，则a点必以十字丝交点o为中心作圆周运动（说明o＇已与o重合）（图3-5E）。或移动薄片，使a点移至十字丝交点，旋转物台，若a点固定不动，说明中心已校好。反之a点必仍以o＇（经初校，已靠近o）为圆心作圆周运动，则需要重复前述操作至完全校正为止。
6）若偏心很大，转动物台，a点物像由十字丝交点转动到视域之外，则根据a点移动情况，估计物像旋转轨迹中心o＇的位置，转动校正螺丝，使点a向旋转中心o＇的反方向移动相当于偏心圆半径的距离，然后按偏心不大的情况校正（图3-6）。
5.目镜十字丝的正交检验
在测定矿物光学性质时，目镜十字丝是否正交很重要。检验时，先将具有直边的矿物移在视域中心，并使矿物的直边与十字丝之一平行，记下物台读数。转动物台90°，观察另一十字丝是否与矿物直边平行（图3-7）。若不平行说明十字丝不正交，需要专门修理。
图3-6 中心偏离较大时，校正中心的示意图
图3-7 十字丝的正交检查
6.偏光镜的校正
在偏光显微镜的光学系统中，上、下偏光镜振动方向应当正交，而且是东西、南北方向，它们分别与目镜十字丝平行。校正方法如下：
（1）确定及校正下偏光镜的振动方向使用中倍物镜准焦后，在岩石薄片中找一个具极完全解理缝的黑云母置于视域中心。转动载物台，使黑云母的颜色变得最深为止。此时，黑云母解理缝方向代表下偏光镜振动方向（因为光波沿黑云母解理缝方向振动时，吸收最强，颜色最深）。如果黑云母解理缝方向与目镜十字丝的横丝（东西方向）平行，则下偏光镜位置正确，不需要校正。如果不平行，转动载物台，使黑云母解理缝方向与目镜十字丝的横丝平行（图3-8），旋转下偏光镜，至黑云母的颜色变得最深为止。此时下偏光镜振动方向位于东西方向。
图3-8 下偏光镜振动方向的校正
（据李德惠，2002）
（2）检查上、下偏光镜振动方向是否正交
使用中倍物镜，调节照明使视域最亮。推入上偏光镜，如果视域黑暗，证明上、下偏光镜振动方向正交。若视域不黑暗，说明上、下偏光镜振动方向不正交。如果下偏光镜振动方向已经校正至东西方向，则需要校正上偏光镜振动方向。转动上偏光镜至视域黑暗为止（相对黑暗）。如果显微镜中的上偏光镜不能转动，则需要作专门修理。
经过上述校正之后，目镜十字丝应当严格与上、下偏光镜振动方向一致。但有些显微镜的目镜没有定位螺丝，使用过程中或更换目镜时，可能使目镜十字丝位置改变，因此，需要校正目镜十字丝的位置。
（3）检查目镜十字丝是否严格与上、下偏光镜振动方向一致
1）在岩石薄片中选一个具极完全解理缝的黑云母，置于视域中心，转动载物台，使黑云母解理缝与目镜十字丝之一平行。
2）推入上偏光镜，如果黑云母变黑暗（消光），证明目镜十字丝分别与上、下偏光镜振动方向一致。如果黑云母不全黑暗，转动载物台，使黑云母变黑暗。推出上偏光镜，旋转目镜，使十字丝之一与黑云母解理缝平行。此时目镜十字丝与上、下偏光镜振动方向一致。
7.视域直径的测定
（1）测量中倍或低倍物镜的视域直径，可以直接使用有刻度的透明尺测定。测定时，将透明尺置于载物台中心部位，对准焦点后，观察视域直径的长度值，记录该数值备以后查用。
（2）测量高倍物镜的视域直径，可以使用物台微尺测定。物台微尺是嵌在玻璃片中心的一个小微尺。微尺的总长度为1～2 mm，其中刻有100～200个小格，每小格等于0.01 mm。测量时将物台微尺置于载物台中心，对准焦点，观察视域直径相当于物台微尺的多少小格，若为20格，则视域直径等于20×0.01 mm=0.2 mm。