如何设计启动子引物

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第1个回答 2014-02-18

这个一般要多试几次的，Forward的话从5‘UTR上游3000（一般的就够了）开始每隔500设置一个，Reverse的话设置在5‘UTR附近，可以进入mRNA。PCR之后转入带标记的载体看看Maker表不表达，表达的就是OK的，取长度最小值就可以。
另外，可以去一些网站看看，他们都可以做些预测，这样可以少走些弯路。本回答被提问者和网友采纳

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谁知道启动子的引物怎么设计,要求具体,越详细越好,而且是能实际操作的...答：这个一般要多试几次的，Forward的话从5‘UTR上游3000（一般的就够了）开始每隔500设置一个，Reverse的话设置在5‘UTR附近，可以进入mRNA。PCR之后转入带标记的载体看看Maker表不表达，表达的就是OK的，取长度最小值就可以。另外，可以去一些网站看看，他们都可以做些预测，这样可以少走些弯路。

用引物扩增获得启动子的方法答：1、确定启动子位置：首先需要确定目标基因的启动子位置，这可以通过基因组序列信息或者已知的启动子序列进行比对得到。2、设计引物：根据启动子的位置，设计一对引物，引物应该能够特异性地结合启动子区域的DNA序列。3、扩增DNA片段：使用设计的引物进行PCR扩增，扩增产物应该是包含目标启动子序列的DNA片段。4...

引物的设计原则答：5、引物之间：两个引物之间不应有多于4个的互补或同源碱基，不然会形成引物二聚体，尤应避免3’端的互补重叠。6、上下游引物的互补性：一个引物的3‘末端序列不允许结合到另一个引物的任何位点上。7、3’末端：如果可能的话，每个引物的3‘末端碱基应为G或C。8、引物应当超出限制性内切酶识别位点...

引物的引物设计答：引物设计有 3 条基本原则：首先引物与模板的序列要紧密互补，其次引物与引物之间避免形成稳定的二聚体或发夹结构，再次引物不能在模板的非目的位点引发DNA聚合反应(即错配)。具体实现这 3 条基本原则需要考虑到诸多因素，如引物长度（primer length），产物长度（product length），序列 Tm 值 (melting ...

怎么替换启动子,以及引物怎么设计答：回答：不是的,这是两个不同的概念: 启动子:是指转录起始复合物结合的一段dna序列引物:是dna复制时,用于结合dna一段序列具体正确的描述可以去生化书上查肯定是有的

引物设计问题答：内源启动子和上段相比就是生物自己本身的启动子，不是外源（异源）的。我们需要把一段基因序列连接到特定的引物上并要满足一定条件（突变/酶切位点等），需要在基因的两端取一段序列加或不加修饰使PCR扩增出来的片段可以满足我们的需求（扩增后的片段回收后经过酶切/连接构建到载体上）。这个问题比较...

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