因为曹丕将“太祖”这一庙号用在了曹操身上，所以自己只能使用“高祖”这一庙号了。
根据史料记载，司马炎称帝后，追尊司马懿为宣皇帝，庙号高祖。至于自己的父亲，司马炎在建立西晋后，追尊司马昭为文帝，庙号太祖。
由此，对于司马炎这位开国皇帝，因为西晋的江山离不开司马懿、司马昭的努力，所以将高祖、太祖的庙号用在了他们身上，而自己只使用了“世祖”这一庙号。
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称号的由来：
在三国这一历史阶段，曹丕是曹魏开国皇帝（220年—226年在位），魏武帝曹操次子，与正室卞夫人的嫡长子。黄初七年（226年），曹丕病逝于洛阳，时年四十岁。谥号文帝，庙号高祖（《资治通鉴》作世祖），葬于首阳陵。对于曹丕来说，作为开国皇帝，其庙号却是“高祖”。
与此相对应的是，对于刘邦、赵匡胤、朱元璋、努尔哈赤等开国皇帝，则使用“太祖”这一庙号。在中国古代历史上，庙号虽然始于商朝时期，不过，真正地在皇帝中推行开来，则始于西汉时期。对于西汉的开国皇帝刘邦来说，庙号是“太祖”。不过，因为其谥号为高皇帝。
所以又被称为汉高祖。自刘邦之后，不少开国皇帝都使用“太祖”这一庙号，比如宋太祖赵匡胤、明太祖朱元璋等皇帝。虽然曹操生前仅仅是魏王，不是曹魏的开国皇帝，但是，对于曹魏的基业，却是曹操一手打下来了。
在东汉末年，群雄逐鹿中原，曹操消灭了袁绍、袁术、吕布、张绣等众多诸侯，一统北方中原地区。正是在曹操的基础上，曹丕才能于公元220年迫使汉献帝刘协让位，进而建立曹魏这一国家。显而易见的是，曹操之于魏国，正如同刘邦之于西汉，所以他们都使用了“太祖”这一庙号。
在曹丕之后，就西晋的开国皇帝司马炎来说，也没有使用“太祖”这一庙号，而是使用了“世祖”的庙号。对于司马炎来说，和曹丕一样将太祖的庙号追封给了别人。根据史料记载，司马炎称帝后，追尊司马懿为宣皇帝，庙号高祖。至于自己的父亲，司马炎在建立西晋后。
追尊司马昭为文帝，庙号太祖。由此，对于司马炎这位开国皇帝，因为西晋的江山离不开司马懿、司马昭的努力，所以将高祖、太祖的庙号用在了他们身上，而自己只使用了“世祖”这一庙号。
参考资料来源：百度百科-曹操
参考资料来源：百度百科-草丕
原因：
1、可使用“祖”的条件：
（1）开国皇帝；
（2）开国皇帝的祖先；
（3）完成从局部到全国政权转变的皇帝；
（4）盛世明君。
开国皇帝一般被称为“太祖”或“高祖”；后面的皇帝一般称为“宗”。曹丕为开国皇帝，所以曹操曹丕都具备称号“祖”的条件。
2、因为曹操曹丕都称“祖”，故不能重复。曹操在前，肯定称“太祖”，曹丕也就用了最常见的“世”。再说，“祖”称号的泛滥，就是从曹魏开始的。
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历史渊源
庙号早在商朝就已设立，对国家有大功、值得子孙永世祭祀的先王，就会特别追上庙号，以视永远立庙祭祀之意。
当时庙号只有四种：创基立业曰“太”（太祖汤、太宗太甲）、功高者曰“高”（高祖王亥、高宗武丁）、世代祭祀曰“世”（世祖盘庚、世宗祖甲）、中兴者曰“中”（中宗太戊，一说祖乙），另外按照“祖有功而宗有德”的标准，给予祖或宗的称号。这些是最早出现的庙号。
商朝灭亡后，周朝没有延用商朝的庙号制度，只是继续发展了商朝的谥号制度，所以周朝君主有谥号而无庙号，再到始皇帝建立华夏第一个集权皇朝—秦朝之后。
将庙号连同谥号制度一并废止，原因是“庙号和谥号”的定夺将会形成“子议父、臣议君”的局面，因此废除谥法与庙法。故周朝到秦朝时期，庙号一度被废止了近千年之久。
西汉以后承袭了庙号这一制度。汉朝对于追加庙号一事极为慎重，不少皇帝因此都没有庙号。刘邦是开国君主，庙号为太祖，谥号为高皇帝（谥法无“高”，以为开国立朝功最高，故特起名焉，齐高帝萧道成，秦高帝苻登亦然）。
汉朝强调以孝治天下，所以除刘邦外，继嗣皇帝谥号都有“孝”字。两汉皇帝人人都有谥号，但有庙号者极少，尤其是西汉，非有大功大德者不能拥有。
参考资料来源：百度百科-庙号
但是由于曹操是曹丕的爸爸，而且功勋卓越，所以庙号太祖。
还有很多不是开国皇帝庙号是祖的，比如康熙是圣祖皇帝，主要是因为他的政绩很好，难得一见的盛世明君。