集体土地工业用地土地使用权流转的注意事项有：
1.要有明确流转范围。把集体建设用地使用权流转限定在存量的流转。
2.合理分配土地流转收益。集体建设用地流转中的土地收益，应按照初次分配基于产权、再次分配税收参与的原则，确立分配比例和额度。
3.不得改变土地的性质和用途。农村土地流转不得改变土地集体所有性质、不得改变土地用途、不得损害农民土地承包权益。
4.合理确定农村土地流转期限。根据《合同法》的规定，租赁合同期限不得超过20年。租赁期间届满，当事人可以续订租赁合同，但约定的租赁期限自续订之日起仍不得超过20年。