法律分析：首先工作岗位的变更(含薪资变更)属于劳动合同实质内容的变更，需要双方协商一致。单方作出的行为无效。其次，工资收入以劳动者实际获得数额为标准，不完全依照劳动合同。再次，单位认定不服从调配就是自动离职没有法律依据，是不成立的。如果单位无合法理由，擅自解除劳动合同，属于违法解除，可以主张继续履行合同或者主张经济赔偿金，标准为经济补偿金的二倍，即每工作满一年支付两个月工资赔偿，工资以最后12个月平均工资计算。公司赔偿46万元可以看是否符合该要求。
法律依据：《劳动合同法》第三十五条 用人单位与劳动者协商一致，可以变更劳动合同约定的内容。变更劳动合同，应当采用书面形式。
变更后的劳动合同文本由用人单位和劳动者各执一份。