于姓的来源主要有四个方面：
首先，于姓起源于姬姓，是周武王姬发的后代，以国名为姓。根据《新唐书·宰相世系表》的记载，周武王克商后，大举分封诸侯，他的第二个儿子被封在国。而《广韵》记载，西周初年，周武王封第二子（或说第三子）于国（今河南省沁阳西北于邰镇），称于叔。后来，于叔的子孙就以国名为姓，有的姓了于；有的则去邑旁姓于，是为河南于氏，史称于姓正宗。
其次，于姓出自古复姓淳于氏，为唐代时避讳宪宗李纯所改单姓于氏。据《古今姓氏书辩证》等记载，淳于锋迅誉公子孙，以国名为姓，称为淳于氏。唐贞观年间所定皇族七姓，有淳于氏。至唐宪宗李纯时，为避讳（“纯”“淳”同音），复姓淳于氏改为单姓于氏。到了宋代，又有部分于姓恢复淳于姓，也有一部沿袭未改的，形成此支于氏。
第三，于姓出自北魏时的万忸于氏，为孝文帝汉化改革时，恢复本姓于。据《路史》所载，鲜卑族的万忸于氏原为山东于姓人，后随鲜卑改之，孝文帝汉化改革，又复于姓。
最后，于姓还出自赐姓或少数民族改于姓而来。明朝时赐元人巴延达哩姓于名忠，清朝时，南方的部分尼玛哈氏改于姓。又有达斡尔、鄂伦春、土、回、高丽等小数民族有改于姓者。
得姓始祖于叔。为周武王姬发之次子（一说第三子），武王灭商后，大举分封诸侯，他把于国分封给于叔，起初于叔为于叔，其名得于封地。后来于国昌盛的子孙就以国为姓，有的姓了于，后来干脆去掉邑旁姓于，称为于姓，史称于姓正宗，是为河南于氏，后世于姓尊于叔为于姓的得姓始祖。
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