蹲厕时间太长会使盆腔静脉血液回流受阻，血管扩张，易诱发痔疮，甚至失去了直肠对粪便刺激的敏感性，久而久之会引起便秘，严重则会发生肠道癌。久坐马桶还会使脑部发生暂时供血不足，起立时易发生晕厥、跌倒等现象，特别是久病、体弱、年迈者，起立时更容易发生意外。
心脑血管病患者如果蹲厕时间过久，排便结束后快速站立容易诱发短暂性脑缺血，发生头晕、眼花、摔倒，且年龄越大的人越容易受伤。此外，高血压患者晨起血压会更高，很多人有起床后排便的习惯，因此容易发生意外。可在厕所蹲位旁设置安全护栏，如厕后，起身需缓慢。
排便太用力易导致肛裂或猝死。现代人生活节奏快，连上厕所都匆匆忙忙，排便时速度过快，一上厕所就大力憋气排便，就有可能把肛管撑破，造成肛管的皮肤裂口。此外，用力排便还会增加猝死风险。当用力屏气排便时，腹壁肌和膈肌强烈收缩，使腹压增高，血压骤升可导致脑溢血，心肌耗氧量的增加可诱发心绞痛、心肌梗塞及严重的心律失常，两者都可能造成猝死。