不典型性牙痛性质不如典型牙痛剧烈，疼痛时间并不长，但有规律性。冷热刺激时并不会激发出明显的牙痛症状，牙齿不松动且可以咀嚼一般食物。不典型牙痛时以隐痛为主，一般情况下均可忍受，不需要服用镇痛类药物。因为这种牙痛性质除了不剧烈外，牙痛持续时间不长，往往是不被重视原因之一。有人认为，不典型性牙痛多发于慢性牙髓炎牙齿，可以是慢性牙髓炎在机体抵抗力下降时出现的瞬间牙痛。不典型性牙痛具有规律性，常常发生于下午的3〜4时或夜晚8〜9时，一般与饮食无关。虽具有自发性牙痛性质，但并不会因为牙痛而影响睡眠，久拖不治者常采用的对策是睡前服镇痛药。
而且白天也没有因为牙痛而影响工作。不典型性牙痛对冷热刺激痛不敏感的原因是有的牙髓做过治疗（如干髓术），也有的牙齿做过根管充填，有的是慢性根尖周炎病变。各种各样的原因均可是诱发不典型性牙痛，而构成病因的常是牙髓治疗后或牙齿充填后继发性感染。如果把残髓炎、继发龋等看作可能引起不典型性牙痛因素的话，那么残髓炎或/和慢性根尖周炎的治疗，可能是控制不典型性牙痛的最主要手段。不典型性牙痛具有时隐时现的特点，可解释这一特点诸多因素中，应该与机体抵抗力有关，可以因为劳累或某种疾病导致抵抗力下降时，即是不典型牙痛发病之时。可以说不典型性牙痛是潜在性病变，反复发作可能导致病变程度加重。不典型性牙痛，一般情况下定位比较准确，能够指定病变牙齿的好处是有利于诊断。
不典型性自发痛是值得重视的：并非所有的牙髓炎患者都有典型的自发痛症状。如龋坏已经穿通牙髓具有减压引流作用的牙痛可以是不典型性的；慢性牙髓炎急性发作时可表现为不典型性自发痛，可呈规律性表现是每曰下午餐前痛或发病期间的睡前隐痛；逆行性牙髓炎在大量抗生素作用下的牙痛有不典型性自发痛表现。对于不典型性自发性隐痛病例可能存在漏诊现象，不敢说这种牙痛对患者生活质量有多大影响，就说这种不典型性牙痛病变可能会影响到牙齿的治疗效果等问题。
牙疼表现在口腔中的一些慢性炎症，长时间不能完全的消除，当人体的抵抗能力下降的时候，细菌和其他致病因素就会通过各种途径进入身体的其他部位和器官进行繁衍，造成其他脏器的损害，进而影响全身的健康。牙疼还会引发一些疾病，这些疾病主要是包括心脏病中的亚急性细菌性心内膜炎，这是临床上常见的比较严重的疾病。对人体的危害是非常的严重的，主要是因为病牙中的绿色链球菌。病牙的细菌可能会造成风湿性关节炎，除此之外，口腔与耳、眼器官相连，病牙也是很容易引起这些人体的器官感染的，比如中耳炎，视神经炎等等。
