1949年12月，政务院创立了机构编制审查委员会，负责审核各行政部门和直属企事业单位的机构设置与编制初步计划。此委员会的日常工作随后由1950年3月设立的全国编制委员会接手，负责全国地方编制的管理，而中央编制委员会办公室则设在财政部内进行干部培训工作。
1950年9月，人事部成立，接过了机构编制审查委员会的部分职责。随着编制工作的深入，1951年12月，省（市）以上的地区开始设立编制委员会，人事部门具体负责其日常运作。国务院人事局在1954年成立，统一管理中央和地方的国家机构编制，进一步加强了中央对编制工作的控制。
1956年，中央、省（市）、县三级都设立了编制委员会，并在同年将国务院编制工资委员会改名为国务院编制委员会，负责机关编制和工资制度的制定。随着机构调整，1958年，国务院编制委员会和人事局曾一度合署办公，而1960年中央国家机关精简小组成立后，编制委员会办公室成为其办事机构。
1962年，国家机关编制小组成立，调查研究全国行政编制问题。1970年，国家编制委员会撤销，编制工作直接由国务院管理。1975年，国务院办公室设立编制小组负责日常工作，直至1978年恢复国家编制委员会，全面负责全国行政编制的管理。
1982年，国家编制委员会被撤销，合并入劳动人事部，随后在1988年，国务院再次设立国家机构编制委员会，总理兼任主任，办公室设在人事部。1991年，中央机构编制委员会（中央编委）和中央机构编制委员会办公室（中央编办）成立，既是党中央的机构，又是国务院的机构，设有多个内设机构处理日常工作。
2004年，中国机构编制管理研究会在民政部的同意下成立，进一步深化了编制管理领域的研究和实践。
中央机构编制委员会办公室(SCOPSR)是中央机构编制委员会的常设正部级办事机构，在中央机构编制委员会领导下负责全国行政管理体制和机构改革以及机构编制的日常管理工作。