自家商用的住房遭遇拆迁时，政府拆迁部门应当给予以下补偿：1、房屋价值补偿；2、临时安置补偿；3、搬迁费补偿；4、搬迁奖励、补助。就上述补偿，政府拆迁部门应与被拆迁人协商签订拆迁补偿协议，确定具体的补偿方式和补偿金额。自家商用的住房遭遇拆迁时，政府拆迁部门是否给予停产停业损失补偿，要根据实际情况判断。 一般来说，如果自家商用住房符合以下条件，政府拆迁部门应当给予停业停产损失补偿：1、持有合法的营业执照。2、营业执照中记载的住所与被拆迁房屋地址一致。3、住宅产权证中登记的产权人，从未作出任何放弃停产停业损失补偿的书面承诺。
法律依据：《国有土地上房屋征收与补偿条例》第十七条 作出房屋征收决定的市、县级人民政府对被征收人给予的补偿包括： (一)被征收房屋价值的补偿; (二)因征收房屋造成的搬迁、临时安置的补偿; (三)因征收房屋造成的停产停业损失的补偿。市、县级人民政府应当制定补助和奖励办法，对被征收人给予补助和奖励。