截至2016年6月南京市高淳区没有火车站，旅客只能到南京市的火车南站才能乘坐高铁列车。
根据12306官网上查询到的信息显示，截至2016年6月20日止，南京南站到合肥市有高铁列车，部分高铁列车时刻表如图所示。
从南京市高淳区人民政府到南京南站的公交车路线方案如下。
公交线路：机场巴士高淳线 → 地铁s1号线，全程约90.5公里
1、从南京市高淳区人民政府步行约940米,到达高淳长途车站
2、乘坐机场巴士高淳线,经过1站, 到达禄口机场站
3、步行约490米,到达禄口机场站
4、乘坐地铁s1号线,经过7站, 到达南京南站
从南京市高淳区长途汽车站到南京南站的公交车路线方案如下。
公交线路：机场巴士高淳线 → 地铁s1号线，全程约90.5公里
1、从高淳区长途汽车站步行约50米,到达高淳长途车站
2、乘坐机场巴士高淳线,经过1站, 到达禄口机场站
3、步行约490米,到达禄口机场站
4、乘坐地铁s1号线,经过7站, 到达南京南站
5、步行约920米,到达南京南站
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