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我提取的植物总DNA有降解对做RAPD或ISSR有何影响吗?
最好是有经验的或相关专业的帮忙解答,谢谢
如果有影响应该怎么处理
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推荐答案 2008-10-27
关键看降解多严重了
提出DNA后跑胶看
首先看有没的一条明亮的带
如果连明亮的带都没有,那就重提吧
如果有一条很明亮的带,而且带的前面有一些弥散带
那是所含杂质较多,但不影响PCR
如果没有很突出的亮带,而是多条隐隐约约的扩散状的带
那就是大多数都降解了,处理的方法还是重提
使用KIT不如重提来的方便快捷而省钱,更重要的是效果有保证
一般不是用于建库或者NORTHERN的话
DNA提取粗矿一点是没有问题的
即使不加入RNAase也对PCR没有多大影响
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其他回答
第1个回答 2008-10-25
你的降解程度有多少?主带是否清晰?是否降解为弥散装光带?
如果主带清晰,那么对RAPD和ISSR没有什么影响。如果弥散严重,建议使用KIT保留长度10KB以上片段。
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是否能用
植物
根或茎
提取总DNA
用于
RAPD或ISSR
分析?
答:
如果是活体根系提取DNA是没有任何问题的
;块根和块茎等含高淀粉的组织倒是比较困难。如果是幼嫩的组织直接用液氮研磨就可以了,反正做RAPD SSR对DNA的质量要求很低。组织死亡后(没有腐烂),DNA是以200BP整倍数降解的,如果还能够提取DNA,做SSR分析是可以的,如果扩增特异性较高,结果是可靠的。
什么是分子标记技术?
答:
当然,
RAPD
技术受许多因素
影响
,实验的稳定性和重复性差,首先是显性遗传,不能识别杂合子位点,这使得遗传分析相对复杂 ,在基因定位、作连锁遗传图时,会因显性遮盖作用而使计算位点间遗传距离的准确性下降;其次,RAPD 对反应条件相当敏感,包括模板浓度、Mg2 +浓度,所以实验的重复性差 。 1. 3 AFLP 标记技术 扩增片...
CTAB法
提取DNA的
问题。
答:
提
DNA
要多做几个重复,逐个排查问题,当然最终的结果是电泳检测结果说了算的。如果检测条带不清楚一般重提一次,如果仍然不清楚那么就要修改方法了。条带清楚到什么程度就可以用是根据你实验的要求定的,比如
做ISSR或者RAPD
对条带要求就低一点,做SSR要求就要高些。
分子标记
答:
证明了
RAPD
标记OPJ一O1和STS 标记均与Lr28紧密连锁。SIELDLER等[13]利用400个随机引物和14个
DNA
探针筛选近等基因系Lr9的多态性,并通过F2群体进行遗传连锁分析。结果表明2个RAPD标记和一个RFLP标记可以区分抗感品系,且与Lr9紧密连锁。WILLIAM等[14]利用RAPD技术,从400个随机引物中,找到了3个能在...
现代生物技术在药用
植物
产业的应用前景有哪些
答:
台湾中兴大学应用RFLP技术精确鉴定出了苦参与其伪品[2],纪宝玉等[3]对野葛的研究表明,
RAPD
可作为种质资源筛选鉴定的关键技术;郝岗平等[4]将AFLP技术成功应用于丹参的道地性鉴别;潘清平等[5]采用
ISSR
技术为玉竹商品药材的鉴定提供了分子依据等。由此可见,
DNA
分子标记技术是一种有效鉴定药用植物的方法。 表1对几种常...
什么是分子标记?
答:
对任一特定引物而言,它在基因组
DNA
序列上有其特定的结合位点,一旦基因组在这些区域发生DNA 片段插入、缺失或碱基突变,就可能导致这些特定结合位点的分布发生变化,从而导致扩增产物的数量和大小发生改变,表现出多态性。 优点:与RFLP 相比,
RAPD
技术简单,检测速度快,DNA 用量少,实验设备简单,不需DNA 探针,设计引物也...
分子标记有什么优点?
答:
②不受环境
影响
。因为环境只影响基因表达(转录与翻译) ,而不改变基因结构即
DNA 的
核苷酸序列。③标记数量多,遍及整个基因组。④多态性高,自然存在许多等位变异。⑤有许多标记表现为共显性,能够鉴别纯合基因型和杂合基因型, 提供完整的遗传信息。⑥DNA 分子标记技术简单、快速、易于自动化。⑦
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