（1）治疗效果的判断在机体接受抗逆转录病毒治疗后，国际通用的疗效观察指标是病毒载量和CD4+T 淋巴细胞计数。不管治疗前的病毒载量是多少，治疗8 周后，病毒载量比原来下降10 倍，理想的效果为4 ～ 6 个月病毒降至检测不出的水平（病毒载量<50 拷贝/ml 血浆），与此同时，CD4+T 细胞计数在4 ～ 8 周通常增加50 ～ 60 个/mm3，此后每年增加50 ～ 60 个/mm3，通常，治疗一年后，CD4+T 细胞计数一般增加50 ～ 180 个/mm3。治疗一年后，病毒载量在明显下降后，稳定于1000 拷贝/ml 血浆以下，仍视为有效，可以继续接受治疗。
在资源贫困地区或技术条件限制时，可选择淋巴细胞绝对计数以及发生机会性感染作为观察临床疗效的替代指标。一般公认淋巴细胞绝对计数1200 个/mm3 相等于CD4+T 细胞计数200 个/mm3。
（2）治疗失败的判断病毒抑制失败，病毒载量下降不符合上述指标。免疫功能恢复失败，CD4+T 细胞计数持续下降，并或出现临床症状。CD4+T 细胞计数一度上升后逐步下降，病毒载量一度下降后出现反弹，>1000拷贝/ml 血浆。临床治疗失败，表现为病程进展。部分患者接受治疗后病毒载量没有达到上述下降的指标，但CD4+T 细胞数呈上升或上升后趋于稳定，则可以提示抗病毒药物出现部分抑制病毒的作用。
（3）影响治疗效果的因素①依从性差。不规范的用药是影响治疗效果的主要因素，不规范用药包括药物的副反应持续存在并无法控制，使患者不能坚持用药，以及患者对规范用药的认识不足，因此而出现的“不认真”服药。
②药物及疗效不佳。药物配伍直接关系到可能产生的副反应。
③耐药。机体内病毒在治疗过程中产生的耐药现象也是影响治疗效果的主要因素之一。
④药物不良反应。由于抗病毒治疗的药物仅能抑制体内病毒的复制而不能根除病毒，因此，一旦用药即表示患者要终身服药，用药期带来的副作用逐步增多而广泛，精神负担加重，直接影响了患者对抗病毒治疗的依从性。