对于家族性结肠息肉病的治疗，首要原则是针对单纯结肠或结肠息肉的管理。常见的手术方式包括全结肠切除术，可能伴随回肠腹部造瘘或回肠贮袋成形，然后进行直肠吻合术。术后，定期的随访检查直肠残端粘膜状况至关重要。
对于全结肠切除与直肠粘膜剥除的患者，通常会选择回肠贮袋成形术，并结合直肠鞘内肛管吻合术，以确保手术效果和患者恢复。
对于伴有全消化道息肉且无法根治的患者，当出现如肠套叠、大出血等严重并发症时，可能需要进行部分肠切除术，以控制病情进展。
对症支持疗法也是治疗的一部分，包括针对症状的药物和护理措施，以缓解不适和提高生活质量。
在药物治疗方面，对于不能进行手术的患者，庆大霉素、灭滴灵以及一般止血药物可能被用于口服或灌肠治疗。而对于局限于大肠息肉的病例，手术切除是主要手段。
当病变肠段需要切除并出现并发症或息肉恶变时，治疗将包括使用"A"、"B"、"C"项中的药物，如输液、抗生素、止血药以及维生素等，以确保患者尽快恢复并防止进一步的恶化。
在肠道尤其是大肠广泛出现十到数百个大小不一的息肉，严重者可从口腔一直到直肠肛管均可发生息肉，且常伴其他特殊临床征状。本病一般认为与遗传因素有关，常有家族史，病变广泛者除有一般息肉的出血症状外常可发生癌变，故应及时手术，不能手术者也应定期随访预防并发症的发生。