1、参加险种不同
根据《社会保险法》等有关规定，与用人单位建立劳动关系的职工，应当依法参加基本养老、基本医疗、失业、工伤和生育五个险种。灵活就业人员，可以以个人名义自愿参加基本养老保险和基本医疗保险。
灵活就业人员不纳入失业保险的参加人群范围。因此，以个人名义参加社会保险，只能选择参加基本养老和基本医疗保险两个险种。
2、缴费金额不同
用人单位的职工参加社会保险，养老、医疗和失业保险费由用人单位和个人共同缴纳，工伤和生育全部由用人单位缴纳。
以个人名义参加社会保险，一是不用缴纳失业、工伤和生育保险费，二是参加的基本养老和基本医疗保险费，全部由个人缴纳。
职工依法参保是带有强制性的!
如用人单位不为员工办理参保登记，社会保险行政机关将责令限期改正，逾期不改正的，将对用人单位处应缴社会保险费数额一倍以上三倍以下的罚款，并对其负责的主管人员和其它直接责任人员处500元以上3000元以下的罚款。