当您的五羊本田125摩托车遇到故障灯闪烁的情况时，这表明电喷发动机的电控系统可能存在隐患。此时，您应该尽快联系售后服务，以便获取故障代码并进行相应的维修。
需要留意的是，故障灯有时会误报，即使车辆能正常启动和行驶，也建议您亲自或骑车前往售后服务中心进行详细检查和咨询。这可能涉及到钥匙开关接触不良或者相关电气设备插头松动等问题。
关于五羊本田水冷系统的费用，价格会因车型、配置以及地理位置的不同而有所变化。因此，对于精确的报价，我们强烈建议您直接咨询您所在地的五羊本田授权经销商或售后服务中心，他们能提供最新的和准确的费用信息。