基层党组织目前存在的问题的原因：
（一）思想认识不到位。一是部分党员干部理想信念动摇，甚至腐化堕落，丧失了党员干部在广大农民群众中的先锋模范作用，给开展思想政治工作造成了巨大的负面影响。二是部分农村党员干部不善于用新方法解决新问题，因循守旧，致使工作停滞不前。三是极个别村干部一旦当选，就千方百计在“权”上做文章，把权力当成谋取私利的工具。
（二）综合素质不到位。有的村干部对农村政策掌握不多，不懂农村基层工作程序，遇到问题不知如何处理；有的对有关政策理解片面，把握不准，断章取义；有的对如何依法履行职责不清楚，凭经验和主观臆断开展工作；
个别村干部自律意识差，方法简单，作风粗暴，依法行政、依法办事能力差；有的村干部宗旨观念不强，服务意识淡泊，利己思想严重，甚至违法违纪，影响了村干部在群众心目中的形象。
（三）机制管理不到位。一方面制度不健全，缺乏有针对性、可操作性强的基层组织制度，工作无章可循，随意性很大。有的虽有制度，但落实不好，形同虚设。另一方面管理机制不配套，上级党组织对不履行职责和存在这样那样问题的基层党组织成员多是进行批评教育，对那些经教育不改却又达不到党纪国法处理的束手无策
（四）缺乏深入的调查研究。基层党组织由于整天忙于事务性工作，往往容易忽视与工作服务对象面对面的交心谈心，在倾听工作服务对象意见方面还存在着不足。没有深入周到的调查研究就不能得出准确无误的结论，在分析基层党组织在社会管理及其创新工作中时可能就缺乏针对性和可操作性。
（五）经费的制约。由于基层党组织的党务活动经费的不足，所以不能保证党建工作的经常性。党务经费的不足可能会制约党建工作的力度和效率，同时还会影响到基层党组织的社会管理及其创新工作。
扩展资料：
创新基层党建工作的有效措施：
（一）提高认识，创新党建工作的思想观念。农村基层党建工作必须坚持以科学发展观为指导，以改革创新的精神全面推进。
（二）强化管理，健全党建工作机制。要坚持党建工作“两手抓、两手都要硬”的方针，进一步健全和落实机关党建工作机制。
（三）深化认识，构建基层党建工作新格局。
（四）强化措施，促进基层党建工作新变化。
参考资料：
1.党的组织生活制度落实情况不好。党的组织生活制度，涉及表决、学习（理论学习和参观考察等）、汇报、交流、监督（批评与自我批评）、服务、民主评议等多方面的内容。但从实际情况看，基层党组织落实党的组织生活制度普遍不到位。最严重的情况是一些支部除了进行表决（选举、处分党员）、组织参观考察等活动外，其他组织生活一概不开展。比较普遍的情况是有选择性地落实一些组织生活制度。能够完整开展所有组织生活的支部属于极少数。
2.党的组织生活质量不高。从集中学习情况看，理论学习、时政学习和党课走形式的情况比较普遍，主要读读报纸、看看电教片、传达上级精神，学习方式过于生硬，学习内容过于空泛，党员对集中学习内容感到枯燥和厌烦，学习效果普遍不佳。参观考察本是一种比较好的活动方式，但由于普遍不进行总结、引导，结果沦为纯粹的观光旅游休闲。从组织生活的内容看，不少支部开展组织生活时，搞得最多的是参观考察和休闲娱乐活动，而很少开展学习、服务、报告、批评与自我批评等活动。党组织生活变成“缴缴党费，读读文件，看看片子，碰碰杯子”，内容与形式不够丰富，组织生活流于形式，参与者心态淡漠，参与积极性很低。
3.组织生活受党内权力影响较大。党章规定：“不允许有任何不参加党的组织生活、不接受党内外群众监督的特殊党员。”但实际上比较普遍的情况是领导干部的双重组织生活往往落实不了，而且领导干部职务越高、权力越大，越不参加组织生活。一些领导干部几乎从不参加支部组织生活。领导干部这种反面示范，对组织生活的正常开展形成了极为不利的影响。
4.服务党员做得很不到位。党组织为党员提供服务，其内容应该是很丰富的，例如：通过组织学习帮助党员提升理论分析水平与能力，深入理解党的重大政策，帮助党员解决遇到的困难和问题，帮助党员在党组织活动中发挥个人特长、提升成就感，等等。但是，目前除了偶尔开展帮扶困难党员活动外，其他服务开展得很不理想，特别是不注意创造让党员发挥个人特长的机会和条件，党员个人在组织中缺少成就感。
（二）主要原因
1.对基层党组织生活的重要性认识不足。基层党组织是党的组织体系的基础，是党的全部工作和战斗力的基础。党的组织生活是组织建设的基础性工作。所谓基础性工作，就是指很重要，缺了它不行。不仅起不到教育、监督、约束作用，反而降低了党组织的影响力、号召力，削弱了党组织的凝聚力、战斗力。如果党组织主要靠执政的权力吸引党内外人士，主要靠干部任用这个权力来影响党内外人士，则其后果是非常危险的。任何一个组织如果缺少活力，就无法对其成员产生吸引力，无法产生归属感和凝聚力、战斗力。因此，纵观基层组织生活存在的种种问题，归根到底，在于我们对基层组织生活的重要性认识不到位。
2.对基层党组织生活重视不够。党建工作目标管理虽纳入了组织生活的内容，但着重检查记录，基本没有对组织生活质量、效果的测评考核。党建研究方面更注重研究时髦问题，没有重视研究如何有效开展组织生活这类基础性问题。不少单位开展党组织活动的经费不能保证。在开展理论学习、党课方面，对基层党组织的负责人理论培训严重不足，上级党组织又往往没有提供理论宣讲服务，导致基层党组织理论学习内容空泛。
3.党内权力干预组织生活的正常开展。现有的党内权力体制使得党内握有权力的各级主要领导干部客观上处于强势地位，并且在党内的强势程度与其所处党内权力体系的位阶高低、手里权力大小成正比，而一般党员和干部则相应处于权利弱势位置，很难对党内权力进行强而有力的制约与监督。在这样的权力结构特性下，党内同志之间的平等合作奋斗关系就会被扭曲成一定程度上的权力依附关系，出现以权力意志支配党内关系、处理党内事务的潜规则，党章制度的权威也就被权力意志权威所取代。而一旦下级对上级存在着权力依附关系，党内民主就难以保证。本回答被提问者和网友采纳