个体工商户是不可以办理二类医疗器械备案的。
食品药品监督管理总局规定：办理医疗器械备案或者许可的申请主体必须是企业，个体工商户不受理。
如果你要经营二类医疗器械，你的（个体）营业执照可以到工商局办理升级业务。直接到工商局管片的工商所登记、填表，然后拿着相关材料到政务大厅办理营业执照升级，升级为企业，然后到网上申报就可以了。
扩展资料：
关于二类医疗器械的申请与受理：
申请人登陆北京市药品监督管理局企业服务平台进行网上申报，根据受理范围的规定，需提交以下申请材料：
（一）《中华人民共和国医疗器械注册申请表》；
申请企业填交的《中华人民共和国医疗器械注册申请表》应有法定代表人签字并加盖公章，所填写项目应齐全、准确，填写内容应符合以下要求：
1、“生产企业名称”、“注册地址”与《医疗器械生产企业许可证》相同。
2、“产品名称”、“型号、规格”与所提交的产品标准、检测报告等申请材料中所用名称、型号、规格一致。
（二）《医疗器械注册登记表》；
1、“生产企业名称”、“企业注册地址”、“生产地址”与《医疗器械生产企业许可证》内容相同。
2、“产品名称”、“型号、规格”必须与产品标准一致。
3、“产品标准”应填写现行有效的产品标准编号及名称。
（三）医疗器械生产企业资格证明（包括《医疗器械生产企业许可证》副本复印件及《工商营业执照》副本复印件）
1、申请注册的产品应在《医疗器械生产企业许可证》核定的生产范围内。
2、《医疗器械生产企业许可证》和《工商营业执照》应在有效期内。
（四）产品标准（可为国家标准、行业标准或注册产品标准）及有关说明
1、直接采用国家标准、行业标准作为产品标准的，应提交所采纳的国家标准或行业标准的有效文本及采标说明。
采标说明应至少包括产品规格型号的划分、产品的管理类别、产品的出厂检测项目、完全执行此标准的承诺及其它应说明的内容。
2、注册产品标准应提交在有效期内的正式文本、编制说明及复核材料。复核材料包括《北京市医疗器械产品企业标准复核表》、《北京市医疗器械产品企业标准复核意见表》、《北京市医疗器械产品企业标准复核人员名单》。
（五）产品使用说明书
医疗器械说明书应符合《医疗器械说明书、标签和包装标识管理规定》的相应规定，至少应包括以下内容：
1、产品名称、型号、规格。
2、生产企业名称、企业注册地址、生产地址、联系方式。
3、《医疗器械生产企业许可证》编号、医疗器械注册证书编号（申报时该项内容为空白）、产品标准编号；
4、产品的性能、主要结构、适用范围。
（六）注册产品照片
申报企业应按注册产品的不同规格、型号提供5寸以上（含5寸）彩色照片。照片应清晰反映产品全貌。
（七）注册软盘
1、应包括注册申请表、注册登记表、说明书和注册产品标准等内容。
2、软盘中的内容应与申请材料相一致。
3、软盘上应注明申请企业名称和申请产品名称、型号。
参考资料来源：百度百科-二类医疗器械