（1）艾滋病
截至2004 年底全球共有艾滋病约3940 万例，其中2004 年新感染者约为490 万例，艾滋病死亡者为310 万例。在艾滋病死亡病例中，至少有1/3 病例是由艾滋病与结核的双重感染所致。艾滋病与结核病双重感染病例的临床表现是症状和体征多，如体重减轻、长期发热和持续性咳嗽等，全身淋巴结肿大，可有触痛，肺部X 线经常出现肿大的肺门纵隔淋巴结团块，下叶病变多见，胸膜和心包有渗出等，结核菌素试验常为阴性，应多次查痰。治疗过程中常出现药物不良反应，易产生获得性耐药。治疗仍以6 个月短程化疗方案为主，可适当延长治疗时间，一般预后差。
（2）肝炎
异烟肼、利福平和吡嗪酰胺均有潜在的肝毒性作用，用药前和用药过程中应定期监测肝功能。严重肝损害的发生率为1%，但约20% 患者可出现无症状的轻度转氨酶升高，无须停药，但应注意观察，绝大多数的转氨酶可恢复正常。如有食欲不良、黄疸或肝大应立即停药，直至肝功能恢复正常。在传染性肝炎流行区，确定肝炎的原因比较困难。如肝炎严重，肺结核又必须治疗，可考虑使用2SHE/10HE 方案。
（3）糖尿病
糖尿病合并肺结核有逐年增高趋势。两病互相影响，糖尿病对肺结核治疗的不利影响比较显著，必须在控制糖尿病的基础上肺结核的治疗才能奏效。肺结核合并糖尿病的化疗原则与单纯肺结核相同，只是治疗期可适当延长。
（4）矽肺（硅沉着病）
矽肺患者是并发肺结核的高危人群。近来，随着矽肺合并肺结核的比例不断上升，Ⅲ期矽肺患者合并肺结核的比例高达50% 以上。
矽肺合并结核的诊断强调多次查痰，特别是采用培养法。矽肺合并结核的治疗与单纯肺结核的治疗相同。Ⅰ期和Ⅱ期矽肺合并肺结核的治疗效果与单纯肺结核的治疗相同。药物预防性治疗是防止矽肺并发肺结核的有效措施，使用方法为INH 300mg/d， 6 ～ 12 个月，可减少发病约70%。