在最后的大结局中，霍老太太组织去张家古楼的行动，吴邪和小花被分成一组，去往四川四姑娘山墓破解张家古楼三道门的密码。在四姑娘山墓，他们遇到了霍老太太安排的黑瞎子，小花和吴邪历经千辛万苦，终于破解了三道机关的钥匙。
而黑瞎子为了掩护小花和吴邪逃跑，跟尸蟞缠斗，最后拉着黑毛怪一起同归于尽了。至于黑瞎子是死是活，剧中并没有交代清楚，一直到剧集结束，黑瞎子都没有再出现过。虽然看过书的人都知道黑瞎子不会这么容易死，在后面的《沙海》中又出现了，可剧中一点线索都没有，看得很多观众云里雾里的。
拿到第三道门的密码后，吴邪就将密码发给了霍老太太和小哥，两人拿着第三道密码进入了张家古楼。等到霍老太太和小哥等人破了第三道机关，进入了第三道门后，小花才发现无邪给出的密码是错误的。
此时小哥他们已经进去了，吴邪再也联系不上他们，小哥和霍老太太都生死不明。吴邪内疚自责，觉得是自己的失误害了小哥，冲动地想一个人去巴乃张家古楼救小哥，小花拗不过吴邪，只好跟着他一起去张家古楼。
临行前，小花拿出了一张人皮面具，吴邪打开一看才知道是三叔的人皮面具。小花让吴邪易容成三叔的样子，以三叔的身份活着，和她一起去巴乃去救小哥他们。到最后也没交代他们怎么救的小哥和霍老太太，小哥和霍老太太是生是死。
在结尾处，还解释了一下“它”的含义和由来，从吴邪的口中得知，“它”不是一个人，也不是一个组织，它是自古以来所有想获得长生者的总和。在剧中，九门几代人都在对抗着“它”，三叔在对抗着“它”，而陈文锦也知道了“它”的存在，但都不知道“它”到底是谁。
吴邪假装成他三叔之后，在潘子与小花的协助下，整理了他三叔的产业，并且组织了一批人前往张家古楼营救胖子和闷油瓶！
之后碰到艰难的从岩缝里往外爬的胖子，救醒他之后一起再入地下，并最终找到闷油瓶和已死的霍老太，救出闷油瓶以后各归故里！胖子因为那个女子的死留在了那个村子，闷油瓶继续他的看守职业，前往云顶天宫青铜门。
2005年，对张起灵的执念使他不顾一切追到长白山，在青铜门前接受了张起灵给他的鬼玉玺，定下十年之约。
三叔失踪、张起灵离去之后第五年 ，吴邪去西藏墨脱探知张起灵的往事，也看到了世代束缚自己家族敌人的影子，才知道自出生以来，长辈和在乎他的人们所付出的牺牲和无奈，自己迄今为止的全部人生不过是镜花水月，陷入巨大的空白令他几近崩溃。他绝望痛哭于爷爷墓前。
数代人的记忆包括仇恨等情感通过费洛蒙传递到他身上，他已然如同活了几千年。之后，这个善良温和的男子想到的，竟是全面的反击。从墨脱回来后他消失了整整四个月，把自己关在某处不停地反复计算推演，把一个反击的庞大计划设计的决绝而完美。
这个计划需要加快节奏，已经等不到下一代来完成，同样如果计划失败，血脉断绝才是一切彻底结束的最好方法。他去北京找同是九门后人的表亲解雨臣（解语花)，在解雨臣的协助下开始实行计划。