△△Ct是荧光定量计算公式的简化形式,用于比较不同样品之间的差别或变化比率。
Ct=-1/lg(1+Ex)*lgX₀+lgN/lg(1+Ex),其中,n为扩增反应的循环次数,X₀为初始模板量,Ex为扩增效率,N为荧光扩增信号达到阈值强度时扩增产物的量。△Ct(n)=Ct(目的基因)-Ct(内参基因);△△CT(n)=△Ct(n)-△Ct(1)。
起始拷贝数越多,Ct值越小。利用已知起始拷贝数的标准品可作出标准曲线,其中横坐标代表起始拷贝数的对数,纵坐标代Ct值。因此,只要获得未知样品的Ct值,即可从标准曲线上计算出该样品的起始拷贝数。
扩展资料
荧光定量PCR的原理:
荧光定量PCR技术:在PCR反应体系中加入荧光基团,通过荧光信号不断累积而实现实时监测PCR全程,然后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。在实时荧光定量PCR中,对全程PCR扩增过程进行实时检测,根据反应时间和荧光信号的变化可以绘制成一条曲线。
实时荧光定量常用的荧光化学分类有SYBR Green I法和Tag Man探针法。
Ct值:C代表Cycle,t代表threshold,Ct值的含义是每个反应管内的荧光信号到达设定的域值时所经历的循环数。
参考资料来源:百度百科-荧光定量PCR
参考资料来源:百度百科-实时荧光定量PCR
△△Ct这是相对荧光定量的一个计算公式的简化形式,用于比较不同样品之间的差别或变化比率。
Ct= -k lgX0+ b(线性方程)用这个方程可以通过Ct值算出样品的起始浓度
斜率=-1/lg(1+e)
扩增效率E=1, 斜率=-3.32
扩增效率范围:90%-110%
斜率范围:-3.1和-3.59之间
例如,想看a基因和b基因在某细胞系中表达量的差别,选取18s作为内参基因,就用a基因的Ct值减去18s的Ct值,得到△Ct1,用b基因的Ct值减去18s的Ct值得到△Ct2,然后用△Ct1-△Ct2=△△Ct,而a,b基因的表达量差别为2(-ΔΔCt)次方。
当然这计算方法是基于荧光定量的数学计算模型简化来的,平时使用没什么问题,如果两个目的基因的扩增效率不一样,这个计算方法是不能用的。
扩展资料:
荧光定量PCR应用领域
临床疾病诊断:各型肝炎、艾滋病、禽流感、结核、性病等传染病诊断和疗效评价;地中海贫血、血友病、性别发育异常、智力低下综合症、胎儿畸形等优生优育检测;肿瘤标志物及瘤基因检测实现肿瘤病诊断;遗传基因检测实现遗传病诊断。
动物疾病检测:禽流感、新城疫、口蹄疫、猪瘟、沙门菌、大肠埃希菌、胸膜肺炎放线杆菌、寄生虫病等、炭疽芽孢杆菌。
食品安全:食源微生物、食品过敏源、转基因、乳品企业阪崎肠杆菌等检测。
科学研究:医学、农牧、生物相关分子生物学定量研究。
应用行业:各级各类医疗机构、大学及研究所、CDC、检验检疫局、兽医站、食品企业及乳品厂等。
参考资料:百度百科-荧光定量PCR
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