对于2016年款的江淮瑞风S3，特别是那些配有天窗的车型，其市场价值会因车况的不同而有所浮动。如果车辆保养得当，完好无损，可能可以卖出大约35000元左右的价格。而如果车况一般，可能在30000元左右徘徊。具体价格会依据车辆的实际状况进行评估。
根据提供的数据，瑞风S3 2016款 5L 手动豪华型的基础报价是98万，而带有天窗的瑞风S3 2016款 5L 手动豪华智能型的报价则为48万。因此，如果目标是购买带天窗的瑞风S3 2016款 5L 手动豪华智能型，那么预计的购买价格范围大致在48万至50万之间。
值得注意的是，如果车辆保持了较好的状态，比如未曾遭遇重大事故，手续齐全，且未受过洪水侵袭，那么其价格通常会在新车上路价的80%左右。当然，这个只是一个参考，车辆的实际价值还需根据详细的车况报告来判断。