山东药品食品职业学院设有成人教育处，专注于函授教育、执业药师培训、医药行业职业技能鉴定及食品药品监管系统干部培训。学院拥有沈阳药科大学、中国药科大学和中国海洋大学的函授站，为药品、食品行业的从业人员提供函授教育服务。此外，学院设有山东省执业药师培训中心，负责执业药师资格考试辅导及继续教育工作，以及山东省医药行业第二职业技能鉴定所，承担职业技能鉴定任务。
药学系成立于2008年，设有药物制剂、药物分析、中药、生物制药、化学制药和制药机械等七个专业教研室。药学系秉持“为药品食品事业服务，为人民群众健康服务”的宗旨，致力于培养具有创新精神的高素质药学应用型人才，营造积极的学习环境，努力打造药学品牌专业。
食品系设有食品营养与检测、食品加工技术、食品生物技术及食品贮运与营销四个专业，配备有实验室和实训基地，并与多家知名企业合作。教师团队由硕士以上学历的教师组成，具有强大的科研实践能力和丰富的教学经验，致力于“立足胶东半岛，服务食品行业”，以市场为导向，持续优化专业建设，深化教学改革，追求特色专业。
基础系成立于2008年，由化学、外数体和人文社科三个教研室组成。基础部注重软硬件环境的建设，拥有良好的学术氛围。全体教职工以教学为中心，推动改革，提升教学质量，培养青年教师，致力于科研成果的产出，始终秉承“为食品药品事业服务，为人民健康服务”的理念。
山东药品食品职业学院是2005年4月27日经山东省人民政府批准，由国家教育部备案的一所专科层次的全日制公办普通高等学校，是在国家级重点中专山东省医药学校的基础上升建的，是山东省惟一一所专门培养从事药品、食品类高级应用型人才的学院。学院受山东省食品药品监督管理局和山东省教育厅双重管理，以专科层次教育为主，同时承担中专教育任务。