如果是银行自动扣款的话，在网上申报了就可以。如果不是自动扣款的，那么网上报完后去税局开票再到银行缴款。
如果你公司已经在税局签订了三方协议 那么会计在每月申报纳税可以直接到网上申报纳税并且直接在网上划税款给国库单据可以到开户行打印出来，由出纳做日记账、计做账。
但是如果你公司没有签订三方协议 每月会计做好报表和纳税申报表后并盖公司公章 由出纳拿着这些表格到税局缴税税局开具的单据由出纳做日记账、会计做账。
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第二条 下列各项个人所得，应当缴纳个人所得税：
（一）工资、薪金所得；
（二）劳务报酬所得；
（三）稿酬所得；
（四）特许权使用费所得；
（五）经营所得；
（六）利息、股息、红利所得；
（七）财产租赁所得；
（八）财产转让所得；
（九）偶然所得。
居民个人取得前款第一项至第四项所得（以下称综合所得），按纳税年度合并计算个人所得税；非居民个人取得前款第一项至第四项所得，按月或者按次分项计算个人所得税。纳税人取得前款第五项至第九项所得，依照本法规定分别计算个人所得税。
第三条 个人所得税的税率：
（一）综合所得，适用百分之三至百分之四十五的超额累进税率（税率表附后）；
（二）经营所得，适用百分之五至百分之三十五的超额累进税率（税率表附后）；
（三）利息、股息、红利所得，财产租赁所得，财产转让所得和偶然所得，适用比例税率，税率为百分之二十。
参考资料:百度百科▬个人所得税 、中国人大新闻▬中华人民共和国个人所得税法
具体流程如下：
1.【下载网上办税控件】：搜索并打开“××省地方税局”，依次点击【网上办税-网上办税控件下载】，解压并安装办税控件，会有网上办税的操作手册可以参考。
2.【网上办税】：插上电子钥匙USB，依旧可以在地税网点【网上办税】进入，也可以直接点电子钥匙出现的【办事大厅-××地税】，后者默认使用IE浏览器，提示浏览器要是.8及以上版本。
3.【输入密码和口令】：上一步操作即可打开“××地税网上办税平台”，输入用户名即税号，可以直接Copy电子钥匙悬浮框内的，再输入密码和验证码，初始密码为8个1，初次登录可以修改密码的。然后点【登录】就会出现口令，默认“111111”（6个1），输入就可以登录主页。
4.【查询已申报税务】：进入主页，看到个人所得税-工资薪金所得显示上月未申报，12月1日-15日申报11月1日-30日的地税，可以点上方的【统计查询】输入申报月份【查询】就会显示已申报的税务项目。
5.【扣缴个人所得税申报】：依次点主页的【网上办税-代扣代缴-扣缴个人所得税申报】，点右下角的【增行】来添加所得税，输入各项需要填写的内容，零申报收入和其他全部输入为数字0，而税率输入0.03，点【保存】进入下一步。
6.【个税导入模版】：个人所得税可以直接点【增行】在主页进行填写，也可以点下面的【个税导入模版下载】下载模版表格填写内容，比较麻烦，但大致都需要输入×××识别号、×××名称、申报日期、×××号码、所得税项目等内容。
7.【申报成功】：“保存”内容后点【是】和【确定】，即可零申报成功，再点右上角的【返回首页】就能看到“未申报”已经变成“已申报-零申报”，因为员工收入都为0进行了零申报，所以缴费金额也为0。
8.【退出电子钥匙】：可以点申报统计记录，查询已经申报的税务项目，办税成功后记得【退出】电子钥匙，好像是可以直接拔出的。 注：200元的电子钥匙有效期为一年，办理日期有效开始，证书默认开机启动需要设置取消。
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个人所得税（personal income tax）是调整征税机关与自然人（居民、非居民人）之间在个人所得税的征纳与管理过程中所发生的社会关系的法律规范的总称。
英国是开征个人所得税最早的国家，1799年英国开始试行差别税率征收个人所得税，到了1874年才成为英国一个固定的税种。
个人所得税的纳税义务人，既包括居民纳税义务人，也包括非居民纳税义务人。居民纳税义务人负有完全纳税的义务，必须就其来源于中国境内、境外的全部所得缴纳个人所得税；而非居民纳税义务人仅就其来源于中国境内的所得，缴纳个人所得税。
个人所得税是国家对本国公民、居住在本国境内的个人的所得和境外个人来源于本国的所得征收的一种所得税。在有些国家，个人所得税是主体税种，在财政收入中占较大比重，对经济亦有较大影响。
2018年6月19日，个人所得税法修正案草案提请十三届全国人大常委会第三次会议审议，这是个税法自1980年出台以来第七次大修。全国人大常委会关于修改个人所得税法的决定草案2018年8月27日提请十三届全国人大常委会第五次会议审议。依据决定草案，基本减除费用标准拟确定为每年6万元，即每月5000元，3%到45%的新税率级距不变。
2018年8月31日，修改个人所得税法的决定通过，起征点每月5000元，2018年10月1日起实施最新起征点和税率。
个人所得税计算方法：
应纳税所得额=（月收入-五险一金-起征点-依法确定的其他扣除-专项附加扣除）*适用税率-速算扣除数
注：新个税法于2019年1月1日起施行，2018年10月1日起施行最新起征点和税率。新个税法规定，自2018年10月1日至2018年12月31日，纳税人的工资、薪金所得，先行以每月收入额减除费用五千元以及专项扣除和依法确定的其他扣除后的余额为应纳税所得额，依照个人所得税税率表（综合所得适用）按月换算后计算缴纳税款，并不再扣除附加减除费用。
（注1：本表所称全年应纳税所得额是指依照本法第六条的规定，居民个人取得综合所得以每一纳税年度收入额减除费用六万元以及专项扣除、专项附加扣除和依法确定的其他扣除后的余额。
注2：非居民个人取得工资、薪金所得，劳务报酬所得，稿酬所得和特许权使用费所得，依照本表按月换算后计算应纳税额。）
（注：本表所称全年应纳税所得额是指依照本法第六条的规定，以每一纳税年度的收入总额减除成本、费用以及损失后的余额。）
参考资料：
本回答被网友采纳如果是银行自动扣款的话，在网上申报了就可以。如果不是自动扣款的，那么网上报完后去税局开票再到银行缴款。
如果你公司已经在税局签订了三方协议 那么会计在每月申报纳税可以直接到网上申报纳税并且直接在网上划税款给国库单据可以到开户行打印出来，由出纳做日记账、计做账。
但是如果你公司没有签订三方协议 每月会计做好报表和纳税申报表后并盖公司公章 由出纳拿着这些表格到税局缴税税局开具的单据由出纳做日记账、会计做账。
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个人所得税规定：扣缴义务人每月所扣的税款，自行申报纳税人每月应纳的税款，都应当在次月十五日内缴入国库，并向税务机关报送纳税申报表。
工资、薪金所得应纳的税款，按月计征，由扣缴义务人或者纳税义务人在次月十五日内缴入国库，并向税务机关报送纳税申报表。特定行业的工资、薪金所得应纳的税款，可以实行按年计算、分月预缴的方式计征，具体办法由国务院规定。
对企事业单位的承包经营、承租经营所得应纳的税款，按年计算，由纳税义务人在年度终了后三十日内缴入国库，并向税务机关报送纳税申报表。
纳税义务人在一年内分次取得承包经营、承租经营所得的，应当在取得每次所得后的十五日内预缴，年度终了后三个月内汇算清缴，多退少补。
从中国境外取得所得的纳税义务人，应当在年度终了后三十日内，将应纳的税款缴入国库，并向税务机关报送纳税申报表。
各项所得的计算，以人民币为单位。所得为外国货币的，按照国家外汇管理机关规定的外汇牌价折合成人民币缴纳税款。
对扣缴义务人按照所扣缴的税款，付给百分之二的手续费。
参考资料：百度百科-个人所得税政策解读
本回答被网友采纳如果不是自动扣款的，那么网上报完后去税局开票再到银行缴款。本回答被网友采纳
2、申报成功之后，需要在每月15日之前，去银行缴费。一般都是手写一张缴 费单，交到银行去，这个单子要在税 务所领。如果你们单位申请了自动扣款，扣完了之后去银行直接拿回单。
3、每月30日之前，要做个税全员全额扣缴申报。有个专门的申报软件，要在税 务网站上下载。这个申报的金额，要和你月初纳税申报的个税金额一致。追问
我想请教的就是给员工缴纳个税怎么做，平时15号前在网上申报各种营业税等，30号前申报个税全员扣缴，用的就是税务软件，平时工资都是3000元以下所以我就从软件上报了，但现在工资是4000元，要交个税，所以我就不知道是不是也跟往常一样30号前报完个税全员扣缴后直接去银行交还是要先去税务局再到银行？
追答4000的话就像我说的这么报。如果需要交个税，和营业税等流转税一样，也是要在15日之前在税务的网站上做申报，然后去银行交纳。交纳完成后，再在30日前做全员全额扣缴申报。个税过了15日再交就要交滞 纳金了。不用跑税 务局