第一，自己缴费负担重。
如果我们在单位工作，按照《社会保险法》的规定，有劳动者和用人单位共同承担社会保险费。职工本人只需要缴纳基本养老保险缴费基数的8%，用人单位需要缴纳缴费基数的16%。
如果我们是自己缴纳社保，国家虽然会给予一定的照顾，可以按照20%的总比例缴费，可是毕竟比在单位的时候个人多承担了12%。
另外，机关事业单位缴纳保险、公积金的缴费基数是实打实地按照国家统一要求规定缴纳。灵活就业人员自己缴纳保险缴费基数，往往是选择60%的最低缴费基数。如果选择较高的缴费基数，缴纳医疗保险时又不划算。毕竟缴纳医疗保险，大家的住院待遇门诊待遇基本都是一样的，缴费基数高多交钱而已。缴纳城乡居民医疗保险待遇又低，所以是个两难的选择。
假设在职时用人单位按照8000元缴费基数缴费，离职后个人按3000元缴费基数缴费，未来的养老金待遇还是相差非常大的。如果个人也按照8000元缴费基数缴费，基本养老保险20%的比例下，个人每月需要缴纳1600元；住房公积金24%的缴费比例下，个人每月需要缴纳1920元。
第二，没有了职业年金等待遇。
职业年金是国家专门为机关事业单位工作人员建立的补充养老保险机制，有个人缴纳工资的4%，国家负担8%。虽然并不是国家按时拨付，会在职工辞职或者退休时拨款补齐，总之还是非常划算的。如果说我们缴费基数是8000元，辞职后每月相当于亏掉了640元的职业年金。如果以后工资上涨，缴费基数提高，亏损钱数还会更多。
另外，一些事业单位还建立了补充医疗保险机制——公务员医保。可以享受到降低起付线或者提高报销比例的优惠。
像失业保险、工伤保险、生育保险，灵活就业人员都不可以缴纳。所以一旦辞职，实际上一些保障待遇就无法享受了。
辞职必须要有觉悟，自己灵活就业相当于自己给自己打工，也就不能再享受周日、带薪年休假、病假、婚丧假、探亲假等等各种待遇。
第三，影响缴费指数。
实际上，如果我们在机关事业单位工作到退休，退休时2014年10月之前的缴费年限是视同缴费，视同缴费年限期间的缴费指数根据退休时本人的职务职称、薪级等因素确定。退休时的职务职称越高，视同缴费指数就越高。
可是一旦你辞职了，由于企业人员不会按照职务职称来确定缴费指数，要按照企业的养老金计算模式来计算了。多数情况下有视同缴费指数，也只能算作1（上海）。在事业单位退休，视同缴费指数就会高一些。
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