1.豆芽长到第四天到第五天后，缸的顶部就开始出现大小不等的坏菜，症状各异，轻则有个别红根和腐烂，腐烂根呈现黄白色，有异味。重则整个缸顶部豆芽全部腐烂，豆芽难分眉眼，其味奇臭难闻。继续发展，豆芽就会刚刚预生催芽结束，即2厘米时就开始出现长长的红黑僵硬的主根，不再生长，继而发酸发臭。生产者装缸就烂，直至焦头烂额，不得不赔本停产。这就是豆芽生产者最为头痛的恶循环性烂缸，而此种烂缸很难根治，就算挪换生产场地，也不过出一两轮好菜，就又这样了。
2.现在我们根据它的发病原因和处理措施进行一下分析，以求很好地解决这个比较头疼的问题。
原因是这样的：清明前后，大地复苏，气温逐步回升，尤其是地温的升高，常易被人疏忽。而重阳节前后，昼夜温差较大。这些都是生产的不利因素。例如房温冬季为27度的话，缸的下部温度最多也只有二十一、二度（一般在十七、八度），但清明过后则不同，这时如果房温27度，则缸底温度最低也在25度以上。
而此季节也是细菌繁殖活跃期，如果其它消毒、技术措施跟不上，就会导致整个作坊的豆芽发生病变。还有一个原因就是清明时节泡豆时间应比冬季适当短些，如果泡豆时间稍长，就有拟杆菌属钻空子的可能；而重阳节前后，泡豆时间应比夏秋季节稍长些。
当然，排水孔的大小、淋水温度的高低（有的地方自来水管道埋得太浅，水温有时25度以上）都是造成坏菜的因素，也应注意。
第二个就是处理措施：1，清明一过，坚持每星期对作坊彻底消毒一次。消毒方法：将作坊全部封闭后，对整个房间用高效消毒剂或腐菌清每平方米2-5克，生石灰每平方米100-150克，充分搅拌后进行喷洒，生产容器也要采取同样的剂量和方法进行处理。全部做完上述工作后，在火炉口上用1000-1500克硫磺点燃（可配加些锯末），迅速离开，六小时后打开门窗通风两小时后再进入。
2，泡豆时必须加入腐立停，最好在种豆泡好沥干水分后，取一袋腐立停兑24度温水500克拌豆，3小时后再淋入缸回温水，以达预防坏菜的目的。对已经发生病害的豆芽，要在芽出全后，常规淋水1小时后，每袋腐立停兑水500克用喷花壶喷淋豆芽，以避免病菌的感染和蔓延。 使用以上两种方法，一般即可杜绝周期坏菜。
另外还需注意以下几点：
1，清明时节必须注意作坊的良好通风性，由于房间湿度大，加之气温回升较快，细菌繁殖加速，如果通风不良，更易导致多种病菌繁殖，为今后生产埋下隐患（有的细菌存活期可达数月，应每隔十天用石灰干粉洒到房间每个角落）。所以，随着气温的不断升高，应适当延长每日通风时间。
2，淋水也非常重要，排水孔太小，排水不畅，有反水现象就不好。芽温如果过高，确实降不下来，可以适当缩短淋水间隔时间，改六小时为五小时或四小时淋一次。水量必须充足，以求达到降温目的，尤其是已经坏菜的，淋水量更应加倍，以保证做到降温和排污两个目的。3，尽量少用抑制性药物或降低其使用浓度，如无根剂和增粗剂。多用助长性药物并加大使用浓度，如速长剂、赤霉素、水溶AB粉等。
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