编写《发现当代华佗》和《发现黄帝 内经》引发争议，被指柯云路为“骗子神医”当“托”应该反思悔悟。
人物轶事
文学路
他的文学道路从高中开始。那是当时北京最好的一零一中，第一次当堂作文课，语文老师站在柯云路身后看了半天，课后问他，是不是对文学很感兴趣。柯云路说，有一点。“文革”伊始，这位吴姓语文老师因当过右派被学生批斗，受其赏识的柯云路也被牵连，成为“修正主义黑苗子”。
“那天这个老师在宿舍吊死了，宿舍就在学校里，她的尸体被抬出去，人们围观的一大堆，我就远远地看着。那时候的心情大概跟我以后当作家有点关系。”
1966年底，柯云路在北大看到一张大字报，《致林彪同志的一封公开信》，信中对林提出反驳。他认为这张大字报说得正确，便找到了写大字报的两位农大附中的学生。后来两人被抓，柯云路也被抄家。“打倒我的大标语从动物园贴到圆明园。”
1968年，柯云路到山西绛县插队，在农村呆了四年。“挣工分，种地，养猪，磨豆腐，犁地，耙地，扬场，摸爬滚打”，他说他一直在观察着这个社会， “那几年的生活跟我后来的写作有很大的关系，没有这个我怎么能写《新星》呢，写县、乡的干部也写得不像啊。”
1972年，柯云路到位于榆次的山西锦纶厂当工人。1980年，他的处女作《三千万》在《人民文学》发表，并获当年全国优秀短篇小说一等奖。1983年，柯云路加入中国作家协会。
1988年之后，随着“气功热”的兴起，柯云路开始转向东方神秘主义主题，陆续发表多部“研究”气功与特异功能的著作，包括《人类神秘现象破译》、《中国气功大趋势》、《中国气功九大技术》、《生命特异现象考察》等，并自称“特异功能研究者”。后又转入“生产”医学著作，著有《新疾病学》、《发现黄帝内经》等，其《发现黄帝内经》一书竭力鼓吹胡万林，为其套上“神医”光环。在胡万林被立案审查后，柯云路为给其正名翻案，又出版“研究胡万林专著”《重组生命世界》。
“从我写作开始，如果说我有什么特点呢，我非常地单独，非常地独立，单独，孤独，独立，甚至用一个‘独’字也可以。”
柯云路说，他无党派，而“我加入这些党派都是有机会的”；他曾经是山西省政协委员，“再往下很可能升到全国政协委员了”，因从不去开会，这一职务没有得到保留；他身处作协，从不参加任何作协会议。山西作协曾经为十个有贡献的作家分房子，别人一番抢，“出去十分钟上个厕所回来可能就没了”，柯云路不要。他仍然住在榆次一间破平房里，没有卫生间，没有水龙头，家里一洗衣服他就去提水，骑自行车上街，在城乡交界处散步，跟农民聊天，图的是“那地方比较安静，离太原远，没人打搅我”。
“作家里面有很多群体吧？每个作家都可能有一群志同道合人际关系比较接近的朋友，每个作家都可能在苦难的时候呼救，写出比较好作品的时候会有人给他来捧场。我没有。我最困难的时候没有一个人作为朋友来帮助我，我成功的时候也没有人来给我喝一下彩，我完全都是独立行动。没有一个作家能做到像我这样。”
这个特立独行的作家自称“人生最大爱好有三：文学，哲学，科学”。
2014年6月18日洛阳中院消息，洛阳市中级人民法院已立案受理胡万林等四名被告人涉嫌犯非法行医罪一案。胡万林等四名被告人涉嫌犯非法行医罪一案，因案情重大、复杂，新安县人民法院依法报请移送上级法院审判，经洛阳市中级人民法院决定同意移送后，该案已由洛阳市人民检察院以非法行医罪向洛阳市中级人民法院提起公诉，洛阳市中级人民法院已立案受理。
90年代，胡万林曾经被人称作“当代华佗”，被作家柯云路为代表的一批人追捧。从新疆、陕西到河南，胡万林多次非法行医致人死亡。2000年，胡万林以涉嫌非法行医罪被逮捕，后被判处有期徒刑15年。
2013年，刑满出狱的胡万林再次卷入一起“非法行医”命案，22岁的大学生在参加胡万林活动时裸死在一家农家宾馆中。
不过一个文学工作者的危害更大！