清华大学最牛的院系是计算机科学与技术系。
计算机科学与技术系是清华大学最为著名和优秀的院系之一，也是国内计算机科学与技术领域最强的院系之一。该院系拥有一支高水平的师资队伍，包括众多国内外知名的专家和学者，以及大量的优秀青年教师。同时，该院系拥有先进的实验设备和实验室，为学生提供了良好的实践环境和条件。
该院系在科研方面成果丰硕，承担了众多的国家级科研项目，取得了一系列重要的科研成果，为国内外的计算机科学技术发展做出了重要的贡献。同时，该院系也为学生提供了广泛的国际交流机会，帮助学生扩展国际视野和提高国际竞争力。
近年来，随着人工智能、大数据等技术的迅猛发展，计算机科学与技术系的重要性愈加凸显。该院系不仅在传统的计算机科学技术领域保持着领先地位，也在人工智能、大数据等新兴领域取得了重要的研究成果。因此，可以说清华大学计算机科学与技术系是最牛的院系之一。