1、灭菌时间不同
最终灭菌制剂，灭菌为生产工序的最后一步。非最终灭菌制剂是在生产过程某一（或多）工序对半成品或其他材料进行灭菌。
2、生产过程要求不同
最终灭菌制剂的生产过程不要求无菌，在最后一道工序进行灭菌即可，例如大输液产品，在灌装后进行最终灭菌即可。非最终灭菌制剂往往强调生产过程无菌操作，作业区无菌操作与非无菌操作严格区分。
3、产品物理性质不同
最终灭菌制剂一般为耐高温制剂，能在灭菌温度下保持稳定性，不影响成品性质。非最终灭菌制一般是不耐热，而且不能进行成品灭菌的制剂，高温会造成制剂的不稳定。
扩展资料：
最终灭菌的方式
以沸水、蒸气和蒸气加压灭菌。巴氏消毒法：因最早由法国微生物学家巴斯德用于果酒消毒，故名。这是一种专用于牛奶、啤酒、果酒或酱油等不宜进行高温灭菌的液态风味食品或调料的低温消毒方法。
经典的低温维持法（lowtemperatureholdingmethod，LTH）：在61.7～62.8℃下处理30分钟。较现代的高温瞬时法（hightemperatureshorttime或flushpoint，HTST）：在71.6℃或略高温度下处理15分钟。
在上述诸法中，以蒸气加压灭菌效果最好，可用常压蒸气灭菌，也可在高压蒸气锅中（一般使用1千克/厘米2）灭菌,其蒸气温度可达121℃,能将耐热的芽孢在30分钟内全部杀死。但对某些易被高压破坏的物质，如某些糖或有机含氮化合物，宜在0.6千克/厘米2压力下(110℃)灭菌15～30分钟。
煮沸消毒法：采用在100℃下煮沸数分钟的方法，一般用于饮用水的消毒。
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