按约定正常办理辞职即可，但需要按协议赔偿违约金，副标题中可以不用将协议拿回来，毕业后找工作重新签订劳动合同即可。
《三方协议》本来是出于保护大学生就业利益的一个方法，各方（学校、企业和学生）都有义务维护起法律效应，《三方协议》只是一种约定，并不适合劳动法，适用的法律依据是《民法通则》的规定：
第111条：当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定条件的，另一方有权要求履行或者采取补救措施，并有权要求赔偿损失。
第112条：当事人一方违反合同的赔偿责任，应当相当于另一方因此所受到的损失。
扩展资料
三方协议只签试用期合同不签劳动合同：
劳动者被用人单位录用后，双方可以在劳动合同中约定试用期，试用期应包括在劳动合同期限内，劳动合同是试用期存在的前提条件。不允许只签订试用期合同，而不签订劳动合同。
这样签订的试用期合同是无效的，但“试用期”合同的无效，并不导致劳动法对劳动者的保护失效。根据《劳动合同法》第十九条之规定，劳动合同仅约定试用期的，试用期不成立，该期限为劳动合同期限。
北京地区就有规定：北京劳动合同管理规定：只签订试用期合同，试用期后用人单位不愿意再签订劳动合同，劳动者可以反推（如试用期一月，可反推合同期为一年，反推依据按《劳动法》关于试用期限的相关规定）。另外《上海劳动合同条例》对此也有特别的规定。
参考资料来源：中国教育在线-"三方协议"你究竟是个什么鬼?
参考资料来源：百度百科-三方协议