1、物理性质不同
黄铜矿为黄铜黄色，表面常有蓝、紫褐色的斑状锖色。绿黑色条痕。金属光泽，不透明、具导电性，硬度3~4，性脆。相对密度4.1~4.3。
黄铁矿为浅黄铜黄色 ，表面常具黄褐色锖色。条痕绿黑或褐黑。强金属光泽。不透明。解理、极不完全。硬度6~6.5。相对密度4.9~5.2。可具检波性。黄铁矿是半导体矿物，具导电性。在热的作用下，所捕获的电子易于流动，并有方向性，形成电子流，产生热电动势而具热电性。
2、成因不同
黄铜矿
分布较广，可在各种条件下形成。主要通过岩浆作用、接触交代作用、成矿热液作用而结晶形成。共生矿物有黄铁矿、方铅矿、闪锌矿、斑铜矿、辉钼矿、磁黄铁矿、毒砂、辉钴矿、辉铜矿、铜蓝、硫砷铜矿等。非金属矿物有方解石、石英、长石。
不同的成矿作用产生不同的黄铜矿矿物组合。黄铜矿是难于细菌氧化的矿物。在铜硫化物中黄铜矿属于比较惰性。细菌氧化黄铜矿时，铜离子进入溶液。由于铜是一些酶的组成成分，因此微量铜元素对细菌生长是有利的。但是当进入溶液铜离子量大时，会造成毒害。
黄铁矿
是地壳中分布最广的硫化物。在岩浆岩中，黄铁矿呈细小浸染状，为岩浆期后热液作用的产物。接触交代矿床中，黄铁矿常与其它硫化物共生，形成于热液作用后期阶段。
在热液矿床中，黄铁矿与其它硫化物、氧化物、石英等共生；有时形成黄铁矿的巨大堆积。在沉积岩、煤系及沉积矿床中，黄铁矿呈团块、结核或透镜体产出。在变质岩中，黄铁矿往往是变质作用的新生产物。
3、特征不同
黄铜矿
可以从它的颜色和条痕当中鉴别出来；它和黄铁矿相像，但是硬度不如黄铁矿，黄铁矿的硬度是6-6.5；它和金类似，但是硬度比金高，也比金脆，金的硬度是2.5-3；它和黄铁矿一样，在野外很容易被误会为黄金，因此被称为愚人金(Fool's Gold)；
黄铁矿
晶形完好，晶面有条纹，致密块状者与黄铜矿相似。但据其浅黄铜黄色，硬度大，及其具有导电性可与黄铜矿进行区别。性脆，受敲打时很容易破碎，破碎面是参差不齐的。
4、产地不同
黄铜矿
是分布最广的铜矿物，中国的主要产地集中在长江中下游地区、川滇地区、山西南部中条山地区、甘肃的河西走廊以及西藏高原等。其中以江西德兴、西藏玉龙等铜矿最著名。
世界其他主要产地有西班牙的里奥廷托，美国亚利桑那州的克拉马祖、犹他州的宾厄姆、蒙大那州的比尤特，墨西哥的卡纳内阿，智利的丘基卡马塔等。
黄铁矿
世界著名产地有西班牙、捷克、斯洛伐克、美国和中国。我国黄铁矿的探明资源储量居世界前列，著名产地有广东英德和云浮、安徽马鞍山、甘肃白银厂等。
参考资料来源：百度百科——黄铁矿
参考资料来源：百度百科——黄铁矿