1、原理不同；
2、配置不同；
3、成本和占用空间不同。在购买一辆摩托车时你必须要考虑到空气制冷摩托和液体制冷摩托之间的差别。取决于你计划在哪骑行或如何骑行，摩托车的制冷或许对于你做出购买决定和将来你对车子的喜爱程度起着很大的作用。空气制冷摩托行驶时声响更大。
空气制冷的摩托车更加适用于单缸或是并列双缸发动机。空气制冷结构更加简易，包含的需要时常更换，维修昂贵且在事故中容易损耗的组件也更少。空气制冷的摩托车价格相比便宜。摩托赛车倾向于使用液体制冷。在风冷V-Twins发动机中，后缸可以保持较其他部位稍高的温度。液体制冷的引擎，循环流通的液体让气缸盖高温区域保持热量平衡。这更有利于控制爆缸现象和控制排放。燃烧室的表面能够保持足够的热量来支持燃烧，但是温度不会过高以至于导致爆缸现象或是引起过高的氮氧化物排放。