PCR技术，包括基因结构的特异性和定性/定量分析，是胃癌基因检测的重要手段。国内外已经发展出成熟的定量PCR技术，如ELISA法、反向杂交法和荧光法，这些方法主要用于基因表达水平的定性和定量评估，如HP DNA的分析，以及胃癌相关基因（如高表达、低表达或缺失基因）的检测。
对于基因结构的分析，SSCP、RFLP和DNA序列分析等方法具有重要意义，尤其在探究点突变、缺失或插入突变等致癌因素时。PCR-SSCP和PCR-RFLP可以初步筛查，而DNA序列分析则能提供精确的突变信息，但其成本高、耗时且复杂，不适合大规模筛查。目前，国际上正积极研发快速测序技术，虽然有成功案例，但设备昂贵，迫切需要一种准确、通用且成本效益高的DNA序列分析系统。
病理检查中，胃镜活检配合染色观察胃粘膜组织变化，能判断是否存在癌变或癌前病变，如化生、不典型增生、慢性萎缩性胃炎等。对这类病变，可能需要进一步进行基因结构或基因表达的分析，以确定病情严重程度和后续治疗策略。
胃癌发病率较高，居消化道恶性肿瘤的首位。明确其病因与发病机制、寻找早期诊断及有效药物靶点的手段显得尤为重要。目前研究认为，胃癌是一个复杂的多因素、多阶段的过程，涉及大量肿瘤相关基因结构改变与表达异常。基因芯片技术以其快速、准确、高通量地分析数以万计的基因表达谱，发现差异表达基因的优势，显示了其在肿瘤等生物医学领域的应用价值，已有不少应用该技术检测胃癌等肿瘤相关基因表达的报道。