我认为在《火影忍者》中一直流传着这么一句话“佩恩之后无火影”，佩恩入侵木叶之前的剧情一直是大部分火影粉丝认为最经典的一部分。而在佩恩入侵木叶这一篇章结束之后，《火影忍者》的质量和口碑也在慢慢下滑，其中最严重的就是战力的崩坏以及像结印、替身术等设定的消失。
有一部分粉丝会认为如果《火影忍者》在佩恩入侵木叶篇章后完结是最完美的。不过这样的结局虽说完美，但是还是有一些遗憾，那就是主角鸣人只拯救了木叶村，还没有拯救整个忍界，并且像宇智波带土、宇智波斑这样的角色也不会出现了。
除了在佩恩这里完结以外，估计还有人会选择在宇智波斑那里完结。虽然火影的后期一直被人诟病是战力崩坏，角色们都是随手扔大招，但不得不说宇智波带土和宇智波斑这两位反派还是非常有魅力的。特别是宇智波斑，他展现出来的霸气以及让令人绝望的实力，完全有资格成为火影的最终BOSS。
除了最终BOSS的选择以外，作品中角色的感情线也是很多网友认为不合适，特别是佐助和小樱这一对。虽然从一开始小樱就是佐助的脑残粉，但是佐助却是一座冰山，他的眼里只有复仇。即便小樱为了挽回佐助的确做了很多事，但是很多粉丝都无法相信佐助最后会和小樱在一起。当然，粉丝们不相信佐助和小樱会走到一起并不是因为小樱不好，而是佐助的性格问题。
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