土壤中存在着复杂的生物群落，其中自养细菌和富含叶绿素的藻类和蓝藻起着至关重要的作用。它们通过光合作用，将无机元素和简单化合物转化为有机质，这一过程进一步发展为原生质的形成。这些自养生物为异养生物提供了基础，如异养细菌和真菌，它们直接或间接地从自养生物那里获取有机物，然后分解并吸收原生质，转化为新的有机物。
在这一过程中，异养生物的分解作用释放出的二氧化碳和有机或无机酸，会对土壤中的矿物质产生直接影响。土壤中的动物，如微小昆虫和蠕虫，它们以微生物或植物为食，死亡后成为微生物的食物来源，进一步丰富了土壤的有机质含量。植物的生长，特别是根系的扩张，不仅改善了土壤结构，其死亡后的分解同样为土壤增添了有机质。
成土作用是一个多因素的过程，生物学因素只是其中的一部分，它受到许多相互制约的影响，如温度、水分、酸碱度、养分循环等。尽管这里仅提及了生物学因素，但它们在土壤生态系统中的作用不容忽视。
英文名：soil biology。主要研究土壤中各类生物的生命现象、相互关系、以及它们和土壤之间的相互关系的科学，是土壤学和生物学之间的一门交叉学科。