yuzu更好一点。
论流畅度，那yuzu绝对强于ryujinx。yuzu的vulkan异步着色做的很到位。过场，游戏读图，加载，都没有明显的卡顿。而ryujinx就没那么流畅了，只能说比它自己的opengl稍好。
论兼容性，也是yuzu更好。yuzu也已经解决过场动画必闪退的问题。而ryujinx打开大量金手指后大概率会读盘闪退。这方面现在yuzu非常棒，可玩性更好。
论画面还原度，ryujinx更佳。一些屏幕特效粒子只有ryujinx模拟出来了，yuzu都是缺失的。而且ryujinx的vulkan不会出现白屏，水面黄光这些问题。个人觉得这个类似于gc模拟器dolphin早期为了提升速度，不直写ram而是缓存到cache中导致的特效错误很类似。
yuzu也许目前为了速度考虑。比方说下面两张图，图片中能看到绿色类似萤火虫的光点的是ryujinx的vulkan模式。而yuzu无论如何目前就是看不到这个效果的。两边都是vulkan模式，加了分辨率MOD后开2x分辨率。
模拟器选择方法：
对工作室脚本比较友善的是雷神模拟器，其布局以及功能和雷电十分相似，对脚本支持比较好，目前大批市场脚本作者开始选择雷神模拟器作为主要的模拟器，而雷神也是标榜自己为工作室专用模拟器。
还有少数人选择蓝叠模拟器，它是手游模拟器的祖师爷，但是中国区代理植入的广告很多，目前很少人在用，只有少量的脚本在使用上古版本的开源模拟器。
如果不选择多开，比较建议使用夜神模拟器，经过工作室小伙伴测试，夜神模拟器对游戏的兼容比较好，在不多开的前提下比较建议使用。
而国外的游戏用雷电模拟器比较多，首先是他对谷歌三件套的支持以及各国的特供版，无论是韩版，美版，台版，都可以找到他的身影，在国外的游戏中无论是新出的奥丁，还是别的游戏兼容性都是比较好的。
参考资料来源：Yuzu-百度百科