食品案件中违法所得数额的认定应以全部销售收入计算。违法所得，是指行政相对人从事违反国家法律、法规规定的活动，即实施了国家法律、法规禁止的行为，或未履行法定义务的所获得的利益。
一、食品违法所得的认定怎么计算
食品领域有关“违法所得”的规定有以下方面
（一）食品生产环节
2013年食品药品监管体制改革前，食品生产环节的监管由质监部门负责，一般情况下，食品生产领域中违法所得的认定采取“获利说”。其依据是国家质检总局2011年2月发布的《关于实施〈中华人民共和国产品质量法〉若干问题的意见》，该《意见》第十一条“关于“货值金额”和“违法所得”、“违法收入”的计算问题”指出“本法所称违法所得是指获取的利润”。
（二）食品流通环节
机构改革前，食品流通环节的监管由工商部门负责，一般情况下，食品流通领域中违法所得的认定采取“获利说”。
其依据是国家工商行政管理总局2008年12月发布的《工商行政管理机关行政处罚案件违法所得认定办法》，该《办法》第二条规定：“工商行政管理机关认定违法所得的基本原则是：以当事人违法生产、销售商品或者提供服务所获得的全部收入扣除当事人直接用于经营活动的适当的合理支出，为违法所得。本办法有特殊规定的除外。”
（三）餐饮服务环节
食品餐饮服务环节的监管由食药监部门负责，一般情况下，食品餐饮服务领域中违法所得的认定采取“全部说”。
其依据是卫生部2010年3月出台《餐饮服务食品安全监督管理办法》（卫生部令第71号），该《办法》第四十四条规定：“本办法所称违法所得，指违反《食品安全法》、《食品安全法实施条例》等食品安全法律法规和规章的规定，从事餐饮服务活动所取得的相关营业性收入。”
二、没收违法所得的情形与标准
没收违法所得是行政处罚的种类之一，是行政机关或司法机关依法将违法行为人取得的违法所得财物，运用国家法律法规赋予的强制措施，对其违法所得财物的所有权予以强制性剥夺的处罚方式。
法律依据：
《中华人民共和国食品安全法》 第八十六条
违反本法规定，有下列情形之一的，由有关主管部门按照各自职责分工，没收违法所得、违法生产经营的食品和用于违法生产经营的工具、设备、原料等物品
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