历史上的胡宗宪的结局是比较惨的，这和《大明王朝1566》辞官归隐是截然不同的。在严嵩被罢官，严世蕃被逮捕以后，陆凤仪弹劾胡宗宪“贪污军饷、依附严党”等十大罪名。胡宗宪被解除一切职务，然后被押送进京。不过嘉靖考虑到胡宗宪抗倭的功劳，就放过了他。后来，御史抄罗龙文家的时候，又发现胡宗宪的小辫子，胡宗宪再一次下狱。辩解无效之后，胡宗宪只能在监狱中自杀，并留下了绝命诗，“宝剑埋冤狱，忠魂绕白云”。
一直等到了万历皇帝继位的时候，胡宗宪才被平反昭雪，恢复名誉。历史上胡宗宪的结局其实印证了《大明王朝1566》中的台词“朝野都知道，我是严阁老提携的人。千秋万代以后，史书上我胡宗宪还会是严阁老的人。”
历史上的胡宗宪是一个非常有才能的人，也是一个为国家立过大功劳的。比如胡宗宪是个超级学霸，27岁的时候中的进士，那一年全国一共有320人中了进士。他在益都做知县的时候，为了让那些豪强地主纳粮，采取“严信赏罚，以宽济严”的措施，征收税粮超额完成，甚至他还为下一任的官员备好了余粮。
现在提起明朝抗倭，很多人都记得戚继光、俞大猷。但是很少人知道戚继光和俞大猷是胡宗宪的手下的将领，当时在胡宗宪手下的将领，还有谭纶、唐顺之、张四维、刘显等人。整个抗倭的方针也是全部由胡宗宪制定的。东南沿海百年来的倭患，可以说正是靠着胡宗宪才能够成功平定。
不过古代立场往往决定观点，严嵩是奸臣，所以他手底下怎么能有一个为国家做过大贡献的人呢？更何况胡宗宪这个人还巴结过严嵩的干儿子赵文华，甚至为了讨嘉靖皇帝欢心，把俘虏押送到北京城。当时的胡宗宪，甚至还特意养了向田汝成、徐文长这样的饱学之士，专门替他写青词，以及为皇帝报祥瑞。
不过胡宗宪那个时候也有自己难处。无论他仗打得多好，立下了多大的功劳，如果不巴结严嵩等人，不讨好皇帝，他随时都有可能被撤掉。《大明王朝1566》中把胡宗宪的这段历史给略掉了，只突出了他的功劳。